当法院判定房屋买卖合同无效且房产已经过户时，应首先明确合同无效的具体原因，随后通过相互返还财产、赔偿损失等步骤来解决问题；若双方协商不成，则可通过法律途径解决争议。以下是对这一问题的详细分析：
一、确认合同无效的依据
房屋买卖合同可能因多种情形被认定为无效，这些情形包括但不限于：
- 一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；
- 恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；
- 存在重大误解或显失公平；
- 以合法形式掩盖非法目的；
- 违反法律、行政法规的强制性规定。
合同无效需由人民法院或仲裁机构依法认定。在您的案例中，既然法院已经判定合同无效，那么这一步骤已经完成。
二、相互返还财产
根据《中华人民共和国民法典》第一百五十七条的规定，一旦合同被认定无效，双方应相互返还因合同取得的财产。
- 房产返还：卖方有权要求买方将已过户的房产重新过户回自己名下。双方需共同前往不动产登记机构办理相关手续，所需材料包括原房产证、合同无效的法律文书（如法院判决书）、双方身份证明等。
- 购房款及孳息返还：买方有权要求卖方返还已支付的购房款及其产生的合理利息或其他孳息。如果购房款是通过银行贷款支付并产生了利息，该利息也应一并返还。
三、赔偿损失
在合同无效的情况下，有过错的一方应赔偿对方因此遭受的损失，包括直接损失和间接损失。
- 确定过错方：需判断导致合同无效的过错在哪一方，或双方是否有过错及过错程度。例如，若卖方故意隐瞒房屋瑕疵或产权问题，则卖方为主要过错方。
- 计算损失范围：直接损失可能包括税费、中介费等；间接损失可能包括因信赖合同有效而丧失的其他购房机会所造成的差价损失。
- 进行赔偿：根据过错程度和实际损失情况，有过错的一方应承担相应的赔偿责任。如果双方都有过错，则按各自过错比例分担损失。
四、解决争议
在房产返还和损失赔偿过程中，双方可能会就具体事项产生争议。此时，应遵循以下步骤：
- 协商解决：双方应首先尝试通过友好协商解决争议，这通常是最简单且成本最低的方式。
- 法律途径：若协商无果，任何一方均可向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，双方需提供充分证据支持自己的主张，并由法院根据相关法律法规和事实情况做出公正裁决。
五、实际操作中的注意事项
- 及时办理过户手续：在房产返还过程中，双方应尽快办理过户手续，以避免因时间拖延而产生的额外费用或风险。
- 保留相关证据：在处理此类问题时，双方应保留好所有与合同签订、履行及争议解决相关的证据，以便在需要时提供证明。
- 寻求专业帮助：由于此类问题涉及复杂的法律关系和财产权益，建议双方在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保自身合法权益得到充分维护。
总结来说，当房屋买卖合同被认定无效且房产已经过户时，双方应明确合同无效的原因，并按照法律规定相互返还财产、赔偿损失。在解决争议的过程中，应优先考虑协商解决；若协商不成，则可诉诸法律途径。如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。