医疗器械经营企业将器械暂存医疗机构是否违法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合法暂存的情况
符合相关法规与协议：
- 如果医疗器械经营企业与医疗机构之间签订了合法的暂存协议，且该协议符合《医疗器械监督管理条例》等相关法律法规的规定，那么这种暂存行为是合法的。
- 暂存协议应明确双方的权利和义务，包括暂存期限、暂存条件、器械管理责任等，以确保器械在暂存期间的安全和有效。
符合医疗器械管理要求：
- 暂存的医疗器械应符合质量标准，且在有效期内。
- 暂存场所应具备相应的存储条件，如温度、湿度、光照等，以确保器械的质量不受影响。
- 医疗器械经营企业应定期对暂存的器械进行检查和维护，确保其处于良好状态。
二、可能违法的情况
无合法协议或违反协议：
- 如果医疗器械经营企业与医疗机构之间没有签订合法的暂存协议，或者协议内容违反了相关法律法规的规定，那么这种暂存行为可能是违法的。
- 例如，协议中未明确器械管理责任，导致器械在暂存期间发生损坏或丢失，且无法确定责任方时，可能引发法律纠纷。
暂存条件不符合要求：
- 如果暂存场所不具备相应的存储条件，或者医疗器械经营企业未按照要求对器械进行检查和维护，导致器械质量受到影响，那么这种暂存行为也是违法的。
- 这可能对患者的健康造成潜在威胁，并引发医疗纠纷或法律责任。
超出暂存期限或范围：
- 如果医疗器械经营企业超出协议约定的暂存期限或范围进行暂存，且未与医疗机构重新协商并签订新的协议，那么这种暂存行为同样可能违法。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 如果医疗器械经营企业的暂存行为被认定为违法，可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 在严重情况下，还可能涉及刑事责任，如构成非法经营罪等。
建议：
- 医疗器械经营企业在与医疗机构进行暂存合作时，应确保签订合法的暂存协议，并明确双方的权利和义务。
- 加强对暂存器械的管理和维护，确保其符合质量标准和管理要求。
- 如遇法律纠纷或疑问，应及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。
总结来说，医疗器械经营企业将器械暂存医疗机构是否违法，取决于是否符合相关法规与协议、暂存条件是否符合要求以及是否超出暂存期限或范围等因素。因此，在进行暂存合作时，双方应谨慎对待并确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。