针对您提出的“无证运输香烟超过5万怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：
一、主要法律依据
无证运输香烟的行为主要违反了《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例的相关规定。这些法律明确规定了托运或自运烟草专卖品必须持有准运证，无准运证者不得承运。
二、基本处罚措施
对于无证运输香烟且价值超过5万元的行为，烟草专卖行政主管部门将依法进行严厉处罚，具体措施包括：
罚款：根据违法情节，罚款金额通常为违法运输的烟草专卖品价值的20%至50%。由于您提到的运输价值已超过5万元，因此罚款金额将相对较高。
没收违法所得：烟草专卖行政主管部门有权没收因违法运输烟草专卖品所获得的全部收入，以此剥夺违法行为人的经济利益。
没收违法运输的烟草专卖品：在情节严重的情况下，烟草专卖行政主管部门将没收全部违法运输的烟草专卖品，以防止其继续流入市场。
三、特定情形的加重处罚
若存在以下特定情形，处罚将更加严厉：
多次违法：如果行为人多次无证运输烟草专卖品，将被视为屡教不改，处罚将相应加重。
抗拒检查：在执法过程中，如果行为人抗拒检查或试图逃避处罚，也将面临更严厉的处罚。
利用伪装或特种车辆逃避检查：这种行为被视为更加恶劣的违法行为，处罚将更为严厉，可能包括更高的罚款、没收违法运输的烟草专卖品以及可能的刑事责任追究。
四、刑事责任
无证运输香烟的行为，如果情节严重，还可能触犯非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营烟草专卖品，扰乱市场秩序，情节严重的，可处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，将处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或没收财产。
五、建议与结论
鉴于无证运输香烟的严重后果，我建议您严格遵守烟草专卖法律法规，避免从事任何违法运输行为。如果您需要运输烟草专卖品，请务必办理相关的准运证件，并按照规定的数量和路线进行运输。
综上所述，无证运输香烟超过5万元将面临严厉的行政处罚和可能的刑事责任追究。为了维护自身权益和遵守法律法规，请务必合法经营、合法运输。