关于“医院门诊科室设置公安门诊是否合法”的问题，这主要取决于具体的设置情况、目的以及是否符合相关法律法规和医疗机构设置规划。

首先，从一般原则上看，医院门诊科室的设置应当遵循医疗机构的执业许可要求和设置规划，确保医疗服务的质量和安全。如果“公安门诊”是指为特定群体（如公安人员或相关监管对象）提供的专门医疗服务，并且这种设置已经得到了卫生健康行政部门的审核批准，符合医疗机构执业许可要求和设置规划，那么这种设置是合法的。

以金华市婺城区人民医院驻公安监管中心门诊部为例，该门诊部的设置已经得到了金华市婺城区卫生健康局的审核批准，并进行了公示。这表明该门诊部的设置是符合相关法律法规和医疗机构设置规划的，因此是合法的。

然而，如果“公安门诊”的设置没有遵循相关法律法规和医疗机构设置规划，或者没有得到卫生健康行政部门的审核批准，那么这种设置就是不合法的。此外，如果“公安门诊”的设置目的是为了进行非医疗活动，或者存在其他违法违规行为，那么也是不合法的。

另外，值得注意的是，五部委《关于依法惩处涉医违法犯罪维护正常医疗秩序的意见》主要关注的是依法惩处涉医违法犯罪行为，维护正常医疗秩序，并没有直接涉及医院门诊科室设置的问题。但是，该意见强调了医疗机构应当加强内部管理，提高医疗服务能力，保障医疗安全和医疗质量，这间接说明了医院门诊科室的设置应当遵循相关法律法规和医疗机构设置规划，以确保医疗服务的质量和安全。

综上所述，医院门诊科室设置“公安门诊”是否合法，取决于具体的设置情况、目的以及是否符合相关法律法规和医疗机构设置规划。如果设置合法且符合规定，那么就是可以的；如果设置不合法或存在违规行为，那么就是不被允许的。因此，在具体操作中，建议医院在设置门诊科室时，务必遵循相关法律法规和医疗机构设置规划，确保医疗服务的合法性和安全性。