结论：企事业单位在劳务合同中能否指定公司，需分情况讨论，具体如下：

1. 若“指定公司”指劳务合同中约定由第三方公司实际提供劳务（即劳务派遣或劳务外包）
   根据《劳动合同法》第五十九条，劳务派遣单位（用人单位）应当与接受以劳务派遣形式用工的单位（用工单位）订立劳务派遣协议。若企事业单位作为用工单位，需通过劳务派遣单位与劳动者签订劳动合同，不可直接在劳务合同中指定第三方公司作为用人单位，否则可能涉嫌规避用工责任，导致合同无效或承担连带赔偿责任。
   若为劳务外包（如将保洁、安保等业务外包给专业公司），企事业单位可与外包公司签订服务合同，但劳动者应与外包公司签订劳动合同，企事业单位无权直接指定劳动者与特定公司签约。

2. 若“指定公司”指企事业单位要求劳动者必须与关联公司签订合同（如集团内部调动）
   根据《劳动合同法》第三十四条，用人单位发生合并、分立等情况，原劳动合同继续有效，由承继其权利义务的用人单位继续履行。若企事业单位通过资产重组、股权转让等方式将业务转移至关联公司，需与劳动者协商一致变更合同主体，单方指定可能构成违法解除合同，需支付赔偿金。
   若未发生法定情形，企事业单位无权强制劳动者与关联公司签约，否则劳动者可主张原合同继续履行或要求赔偿。

3. 若“指定公司”指合同中约定劳动者需为特定公司提供服务（如借调、共享用工）
   根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致可变更劳动合同内容。若企事业单位与劳动者约定借调至其他公司，需双方签字确认变更协议，明确服务期限、薪酬支付等条款。未经协商一致单方指定，劳动者有权拒绝并要求按原合同履行。

实务建议：

• 企事业单位若需通过第三方用工，应选择合法劳务派遣或外包模式，避免直接指定劳动者签约；
  
• 涉及合同主体变更或借调时，务必与劳动者书面协商一致，保留沟通记录；
  
• 若劳动者拒绝指定安排，企事业单位不得以此为由处罚或解除合同，否则可能面临劳动仲裁或诉讼风险。
  

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