无证运输5万元货物，罚款金额需根据具体运输物品类型及违法情节确定，通常在违法所得金额的3倍至10倍之间，无违法所得或违法所得不足2万元的，可能面临3万元至10万元罚款。以下是具体分析：

1. 法律依据与罚款幅度
   根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，未取得道路运输经营许可擅自从事道路运输经营的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下罚款；无违法所得或违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下罚款。
   若运输的是危险化学品（如易燃易爆物品），则适用《危险化学品安全管理条例》第八十七条，罚款幅度为10万元至20万元，情节严重的可能吊销许可证。

2. 关键影响因素

   • 运输物品性质：普通货物与危险化学品的罚款标准差异显著，后者处罚更严。
     
   • 违法所得金额：若5万元为运输费用（即违法所得），罚款可能为15万至50万元（3倍至10倍）；若无法证明违法所得，则按无违法所得情形处理。
     
   • 情节严重性：如多次违法、造成事故或安全隐患，可能面临更高罚款或刑事责任。

3. 实务建议

   • 主动配合调查：及时停止运输行为，配合行政部门查明事实，可能减轻处罚。
     
   • 争取从轻处罚：若属初犯且未造成危害，可依据《行政处罚法》第三十二条主张从轻或减轻处罚（如积极整改、缴纳罚款）。
     
   • 法律程序救济：对处罚决定不服的，可在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。

提示：具体罚款金额需结合运输物品、违法情节及地方执法标准综合判断。若需进一步分析，可提供运输物品类型、是否发生事故等细节，我将为您详细解答。