关于灭活嗜酸乳杆菌在饲料中的合法使用问题，这主要取决于该物质是否被国务院农业行政主管部门列为禁用物质，以及是否对人体具有直接或者潜在危害。
首先，我们需要明确的是，根据《饲料和饲料添加剂管理条例》的相关规定，在饲料或者动物饮用水中添加国务院农业行政主管部门公布禁用的物质，以及对人体具有直接或者潜在危害的其他物质，或者直接使用上述物质养殖动物的，都是违法的。这类行为会受到县级以上地方人民政府饲料管理部门的严厉处罚，包括责令对饲喂了违禁物质的动物进行无害化处理，并处以3万元以上10万元以下的罚款；如果构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
对于灭活嗜酸乳杆菌这一具体物质，如果它并未被国务院农业行政主管部门列为禁用物质，且经过科学评估确认对人体无直接或潜在危害，那么它在饲料中的使用就是合法的。然而，如果它属于禁用物质，或者对人体有危害，那么使用它就是违法的，并会受到相应的行政处罚。
为了确保灭活嗜酸乳杆菌在饲料中的合法使用，我建议您：
查阅最新的法规和政策：及时关注国务院农业行政主管部门发布的最新公告和规定，了解灭活嗜酸乳杆菌是否被列为禁用物质。
进行科学评估：如果灭活嗜酸乳杆菌并非禁用物质，但您对其安全性存在疑虑，建议进行科学评估，确认其是否对人体有直接或潜在危害。
遵守使用规范：如果灭活嗜酸乳杆菌可以合法使用，也请务必遵守相关的使用规范，确保饲料的质量和安全。
咨询专业机构：如果您对灭活嗜酸乳杆菌的合法使用仍有疑问，建议咨询专业的农业机构或法律机构，以获取更准确和权威的信息。
总之，灭活嗜酸乳杆菌在饲料中的合法使用取决于其是否被列为禁用物质以及是否对人体有危害。为了确保合法合规，建议您及时查阅相关法规和政策，进行科学评估，并遵守使用规范。