关于自建房木材加工是否合法的问题，这主要取决于多个因素，包括木材的来源、加工规模、是否获得相关批准以及是否符合当地的木材经营加工发展规划等。以下是一些详细的解答和建议：

一、木材来源的合法性

首先，您必须确保所使用的木材来源合法。这通常意味着木材必须来自合法的采伐活动，或者从持有合法木材经营加工许可证的供应商处购买。如果木材来源非法，如盗伐、滥伐等，那么您的加工活动也将被视为非法。

二、加工规模与批准

1. 加工规模：根据《中华人民共和国森林法实施条例》及相关规定，木材经营加工单位需要具备一定的条件，包括有合法的木材来源渠道、符合本地区木材经营加工发展规划要求、有与其经营加工规模相适应的固定场所和设施等。如果您的自建房木材加工活动规模较大，可能需要获得相关林业主管部门的批准。

2. 获得批准：在大多数情况下，经营或加工木材需要报县级以上人民政府林业主管部门批准，并领取木材经营加工许可证。未经批准擅自经营或加工木材是违法的，可能会受到林业主管部门的处罚，包括没收非法经营的木材和违法所得，并处违法所得2倍以下的罚款。

三、符合当地木材经营加工发展规划

县级以上地方林业主管部门会根据本行政区域内森林资源状况、年森林采伐限额和木材供给能力等因素，制定木材经营加工发展规划。您的自建房木材加工活动应当符合这一规划要求，以确保木材经营加工的总体发展与森林资源保护发展的总体要求相适应。

四、建议与注意事项

1. 咨询当地林业主管部门：在开始自建房木材加工活动之前，建议您先咨询当地林业主管部门，了解相关法规和政策要求，以及是否需要获得批准或许可证。

2. 确保合法合规：确保您的木材来源合法、加工规模符合规定、获得必要的批准或许可证，并遵守所有相关的法规和政策要求。

3. 建立登记台账：为了便于林业主管部门的监管，您可以建立木材经营加工原料来源的登记台账，详细记载木材的来源和数量。

4. 关注政策变化：木材经营加工政策可能会随着时间和地区的变化而调整，因此建议您定期关注当地林业主管部门的政策更新和通知。

综上所述，自建房木材加工是否合法取决于多个因素。为了确保您的活动合法合规，建议您在开始之前咨询当地林业主管部门并了解相关法规和政策要求。