结论：公司注销时负债能否签协议，需分情况讨论。一般来说，在公司正式注销前，理论上可以就负债问题签订协议，但需谨慎处理，确保协议的合法性、有效性及不会损害相关方利益。若公司已进入清算程序或完成注销登记，则不能再以公司名义签订协议。
一、公司注销前的负债协议签订
法人资格存续：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法人在存续期间依法独立享有民事权利和承担民事义务。因此，在公司正式注销前，公司仍保留其法人资格，具备签订协议的法律能力。
- 这意味着，在公司注销过程中，如果尚未完成清算和注销登记，公司理论上可以就负债问题与其他方签订协议，如债务重组协议、债务转让协议等。
协议的有效性与合法性：
- 签订负债协议时，必须确保协议内容合法合规，不违反法律法规的强制性规定，否则协议可能被视为无效。
- 协议应明确双方的权利义务、履行期限、违约责任等关键条款，以避免后续纠纷。
债权维护与风险防控：
- 签订负债协议时，应充分考虑债权人的利益，确保协议不会损害债权人的合法权益。
- 如果协议涉及债务转让或重组，应按照法定程序进行，如通知债权人、获得债权人同意等，以确保协议的合法性和有效性。
二、公司进入清算程序或完成注销登记后的负债协议签订
清算程序中的限制：
- 如果公司已进入清算程序，根据《公司法》的相关规定，清算组在清算期间应清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、处理与清算有关的公司未了结的业务等。
- 在此期间，公司原则上不得进行与清算无关的经营活动，包括签订新的负债协议。但如果是为了清算目的而签订的协议，如债务清偿协议，则可能被允许。
注销登记后的法律后果：
- 公司完成注销登记后，其法人资格终止，不再具备签订协议的法律能力。
- 如果此时仍以公司名义签订协议，该协议可能被视为无效，且签订协议的个人或组织可能承担相应的法律责任。
三、实际操作建议
谨慎评估：
- 在公司注销过程中，如果考虑签订负债协议，应谨慎评估协议的合法性、有效性及可能带来的法律后果。
- 必要时，可咨询专业律师的意见，以确保协议符合法律法规的要求，并充分保护公司的利益。
明确条款：
- 签订负债协议时，应明确协议的关键条款，如债务金额、履行期限、违约责任等，以避免后续纠纷。
- 如果协议涉及债务转让或重组，应确保获得债权人的同意，并按照法定程序进行。
继受主体责任：
- 如果公司注销后存在继受主体（如子公司或合并后的新公司），应在协议中明确继受主体的责任和义务，以确保协议的连续性和稳定性。
总结：公司注销时负债能否签协议，需根据公司是否已完成清算和注销登记、协议的内容及目的等因素进行综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。