有医院证明的病假，在符合规定的情况下通常不需要扣工资，但具体是否扣工资还需根据员工是否处于法定医疗期内以及公司政策、劳动合同的具体规定来判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、法定医疗期内的病假工资支付规定

1. 法律依据： 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，可享有3个月到24个月的医疗期。

2. 工资支付标准：

   • 在规定的医疗期内，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资。例如，若某员工所在地区的最低工资标准为2000元，则该员工在医疗期内的病假工资至少应为1600元（2000元×80%）。
   • 若劳动合同或集体合同中有关于病假工资的更高标准约定，且该标准高于当地最低工资标准的80%，则应按约定执行。

二、超过法定医疗期的病假处理

1. 法律未强制规定： 超过法定医疗期后，员工仍需要请假休息的，法律并未强制要求用人单位继续支付病假工资。此时，处理方式通常由用人单位的规章制度规定或双方协商确定。

2. 常见做法：

   • 有些单位可能会允许员工继续请假，但按照事假处理，即不支付工资。
   • 有些单位可能会考虑与员工解除劳动合同，但需遵循相关法律法规中关于解除劳动合同的程序和条件。

三、公司政策与劳动合同的影响

1. 公司政策差异： 不同公司对于病假的处理方式和病假工资的支付标准可能存在差异。因此，员工应查阅自己所在公司的相关政策，以了解具体的病假工资支付方式。

2. 劳动合同约定： 劳动合同是员工与用人单位之间的重要约定。如果劳动合同中明确规定了病假期间的工资支付方式，那么双方应按照合同约定执行。

四、实际操作中的建议

1. 及时提交证明： 员工在请病假时，应及时向企业提供有效的医院证明和相关材料，以便企业核实并处理请假事宜。

2. 了解公司政策： 不同企业可能有不同的病假政策和操作流程，员工应提前了解并遵守相关规定，以避免不必要的纠纷。

3. 保留相关证据： 为了维护自己的权益，员工应妥善保管好医院证明、请假申请单等相关证据，以备不时之需。

总结来说，有医院证明的病假是否会扣工资，取决于员工是否处于法定医疗期内以及公司政策、劳动合同的具体规定。在法定医疗期内，员工有权获得不低于当地最低工资标准80%的病假工资。超过法定医疗期或具体支付方式则需参考公司规章制度或双方协商结果。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。