村干部民兵连长在购房时经他人安排少支付了6万元，这一行为确实可能构成违纪，具体可能涉及违反廉洁纪律的相关规定。以下从几个角度进行详细分析：

1. 违纪行为的定性：

   • 村干部作为基层管理人员，应当遵守党的纪律和国家法律法规，保持廉洁自律。在购房过程中，通过他人安排少支付房款，这种行为本质上是一种利益输送或不当得利，可能损害公共利益或他人合法权益，从而构成违纪。

2. 可能违反的具体规定：

   • 根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，党员干部不得利用职务上的便利，为本人或他人谋取不正当利益。村干部民兵连长作为党员干部的一部分，同样需要遵守这一规定。少支付房款的行为，如果被认定为利用职务便利或影响谋取私利，就可能违反廉洁纪律。
   • 具体来说，如果这一行为被查实，可能会依据《中国共产党纪律处分条例》中的相关条款，如第八十五条（利用职权或者职务上的影响为他人谋取利益，本人的配偶、子女及其配偶等亲属和其他特定关系人收受对方财物，情节较轻的，给予警告或者严重警告处分；情节较重的，给予撤销党内职务或者留党察看处分；情节严重的，给予开除党籍处分）或其他相关条款进行处理。虽然该条款直接提及的是为他人谋取利益，但少支付房款的行为在性质上与之相似，均涉及利用职务便利获取不当利益。

3. 行为的法律后果：

   • 除了可能受到党纪处分外，如果这一行为还涉及违法犯罪，如贪污、受贿等，还可能面临刑事责任的追究。不过，在您描述的情况下，少支付6万元房款是否构成犯罪，需要具体分析行为性质、金额大小、情节严重程度等因素。
   • 即便不构成犯罪，违纪行为也可能对村干部的职业生涯产生严重影响，包括但不限于警告、记过、降级、撤职等行政处分，以及影响个人声誉和未来发展。

4. 建议与措施：

   • 对于村干部而言，应当立即停止此类不当行为，并主动向组织说明情况，配合调查处理。
   • 对于组织而言，应当加强对村干部的廉洁教育和监督，建立健全的监督机制，防止类似违纪行为的发生。
   • 对于购房过程中涉及的其他人员，如开发商、中介等，如果存在违法行为或不当行为，也应当依法追究其责任。

总结来说，村干部民兵连长在购房时经他人安排少支付6万元房款的行为，确实可能构成违纪，具体可能涉及违反廉洁纪律的相关规定。建议您或相关村干部立即停止此类行为，并主动向组织说明情况，以避免可能的法律后果和声誉损失。如果您或他人有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。