核心结论：针对您描述的情况，若要证明股权证上原本挂靠的股权被他人取走这一事实，需要从证明股权挂靠关系存在、证明股权被取走的行为以及证明该行为未经合法程序或授权这三个方面来撰写证明材料。以下为您详细说明：
证明股权挂靠关系存在
- 书面协议：如果当初股权挂靠时有签订书面协议，这是最直接有力的证据。在证明中应详细引用协议中的关键条款，例如明确指出协议中关于“甲方（实际股东）将其持有的[具体股权比例]股权挂靠在乙方（名义股东）名下”的表述，同时说明协议签订的时间、双方签字或盖章情况等，以证明该挂靠关系是双方真实意思表示且合法有效。
- 资金往来记录：提供与股权挂靠相关的资金往来凭证，如实际股东向公司投入资金的转账记录，备注中可注明是用于购买挂靠股权的款项；或者公司向实际股东分配利润的记录等。这些资金往来能够从侧面印证股权挂靠关系的存在，在证明中应清晰说明每笔资金的金额、时间、交易双方以及资金用途与股权挂靠的关联性。
- 公司内部文件或决议：查找公司内部涉及股权挂靠的相关文件或决议，如股东会决议中提及股权挂靠事项的条款，或者公司财务报告中对挂靠股权的记录等。在证明中引用这些文件的具体内容，说明其来源和形成过程，以证明公司层面知晓并认可该股权挂靠关系。
证明股权被取走的行为
- 工商变更登记记录：前往公司登记机关（如市场监督管理局）调取股权变更登记的相关资料，包括变更登记申请书、股东会决议、股权转让协议等。如果发现这些资料中存在虚假或未经实际股东同意的内容，导致挂靠股权被取走，应在证明中详细说明变更登记的时间、变更事项以及与实际情况不符的地方。例如，指出股权转让协议中受让方并非实际股东指定的受让人，或者股东会决议的签字存在伪造等情况。
- 公司账目和股权凭证：检查公司的账目记录，查看股权变动在财务上的体现，如股权转让款的收支情况、股权价值的调整等。同时，收集股权凭证（如股权证）的流转记录，如果发现股权证被他人非法获取或篡改，应在证明中说明股权证的原始持有情况、发现异常的时间和地点，以及可能的原因。例如，股权证原本由实际股东保管，但在某一天发现被他人拿走，且之后公司进行了不合理的股权变更。
- 证人证言：寻找了解股权挂靠和股权被取走情况的证人，如公司其他股东、财务人员、经办人员等。在证明中记录证人的姓名、联系方式、与案件的关联性以及证人证言的具体内容。证人应能够陈述股权挂靠的事实、股权被取走的过程和相关细节，以增强证明的可信度。
证明该行为未经合法程序或授权
- 实际股东的声明：由实际股东出具书面声明，明确表示其未授权任何人将挂靠的股权进行转让或变更登记，对该股权被取走的行为不知情且不同意。声明中应详细说明股权挂靠的背景、目的以及实际股东对股权的处置意愿，并由实际股东签字或盖章确认。
- 缺乏合法授权文件：如果在股权被取走的过程中，涉及所谓的授权文件（如授权委托书、股权转让授权书等），应仔细审查这些文件的真实性和合法性。如果发现文件存在伪造、变造或者未经实际股东签字确认等情况，应在证明中说明文件的瑕疵和不合理之处，以证明该行为缺乏合法的授权依据。
- 违反公司章程或相关法律法规：分析股权被取走的行为是否违反了公司章程的规定或者相关法律法规的要求。例如，公司章程可能规定股权转让需要经过特定程序或获得其他股东的同意，而实际股权变更未履行这些程序；或者该行为违反了《公司法》中关于股权转让的限制性规定等。在证明中引用公司章程的具体条款或相关法律法规的条文，说明该行为的违法性。
示例证明模板：
证明
兹证明以下事实：
一、股权挂靠关系存在
[实际股东姓名]（身份证号：[身份证号码]）与[名义股东姓名]（身份证号：[身份证号码]）于[协议签订日期]签订了《股权挂靠协议》，协议明确约定[实际股东姓名]将其持有的[公司名称][具体股权比例]股权挂靠在[名义股东姓名]名下。同时，[实际股东姓名]于[资金投入日期]向[公司名称]投入资金[具体金额]，用于购买上述挂靠股权，转账凭证备注为“购买挂靠股权款项”。此外，[公司名称][股东会决议日期]的股东会决议中也提及了该股权挂靠事项。
二、股权被取走的行为
经查询，[公司名称]于[变更登记日期]在公司登记机关进行了股权变更登记，将原本挂靠在[名义股东姓名]名下的[具体股权比例]股权转让给了[受让方姓名]。然而，在此过程中，[实际股东姓名]并未收到任何关于股权转让的通知，也未参与相关的股东会决议或签署股权转让协议。调取的工商变更登记资料显示，股权转让协议中的签字并非[实际股东姓名]本人所签，且公司账目中也没有记录该股权转让款的收支情况。同时，[股权证编号]的股权证原本由[实际股东姓名]保管，但在[发现异常日期]发现被他人拿走。
三、该行为未经合法程序或授权
[实际股东姓名]在此郑重声明，其未授权[名义股东姓名]或任何其他人将上述挂靠股权进行转让或变更登记，对该股权被取走的行为不知情且不同意。经审查，所谓的股权转让授权文件存在伪造嫌疑，[实际股东姓名]从未签署过该文件。此外，公司章程规定股权转让需要经过全体股东过半数同意，而此次股权变更并未履行该程序，违反了公司章程的规定。
综上所述，上述挂靠在[名义股东姓名]名下的[具体股权比例]股权被他人非法取走，该行为缺乏合法依据，严重损害了[实际股东姓名]的合法权益。
特此证明！
证明人（实际股东签字/盖章）：[实际股东姓名]
日期：[证明日期]
注意事项：
- 撰写证明材料时，应确保内容的真实性、准确性和完整性，所引用的证据和事实应真实可靠，避免虚假陈述。
- 证明材料的语言应简洁明了、逻辑清晰，避免使用模糊或歧义的表述。
- 如果可能，建议对证明材料进行公证，以增强其证明力和法律效力。
如果您在撰写证明材料过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。