关于农村自打水井是否合法的问题，这主要取决于具体的法律法规以及当地的水资源管理政策。以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国水法》的相关规定，国家对水资源依法实行取水许可制度和有偿使用制度。这意味着，在大多数情况下，直接从江河、湖泊或者地下取用水资源的单位和个人，需要向水行政主管部门或者流域管理机构申请领取取水许可证，并缴纳水资源费，才能取得取水权。

然而，该法律也规定了一些例外情况。比如，农村集体经济组织及其成员使用本集体经济组织的水塘、水库中的水，以及家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的，可能不需要申请取水许可证。但这里的关键是“少量取水”，并且具体是否需要申请，还可能受到当地水资源状况、管理政策以及取水用途等多种因素的影响。

接下来，我们来看一个具体的行政处罚案例。在宾川县水务局的水行政处罚决定书中，明确指出了未经批准擅自打井取水的行为是违法的，并对此进行了相应的行政处罚。这个案例说明，即使是在农村地区，如果未经批准擅自打井取水，也可能面临法律责任。

那么，对于农村自打水井是否合法的问题，我的建议是：

1. 了解当地政策：首先，您需要了解当地的水资源管理政策，包括是否需要申请取水许可证、申请流程以及取水量的限制等。

2. 咨询相关部门：如果您不确定自己的行为是否合法，或者想要了解更详细的信息，可以咨询当地的水行政主管部门或者流域管理机构。

3. 遵守法律法规：无论当地政策如何，您都应该遵守国家的法律法规，不要未经批准擅自打井取水。如果确实需要取水，应该按照规定的流程申请取水许可证，并缴纳相应的水资源费。

综上所述，农村自打水井是否合法并不是一个简单的是非问题，而是需要根据具体的法律法规和当地政策来判断。因此，我建议您在行动前务必了解清楚相关规定，并咨询相关部门以获取准确的信息和指导。