结论：做亲子关系证明本身并不会因为超生而直接导致处罚，但超生行为本身可能会面临相应的社会抚养费征收等行政处罚措施，这两者是分开的。下面我将从多个角度为你详细分析。
一、亲子关系证明与超生处罚的独立性
亲子关系证明，通常是为了确认父母与子女之间的生物学或法律上的关系，这一过程本身并不涉及对生育行为的合法性评价。也就是说，无论你是合法生育还是超生，进行亲子关系证明都是为了明确亲子关系，这一行为本身不会因为超生而受到处罚。
二、超生可能面临的处罚
超生，即违反计划生育政策生育子女，根据过去的计划生育法规（虽然现在政策有所调整，但超生行为在特定历史时期是存在的），超生者可能会面临社会抚养费的征收等行政处罚措施。这些处罚是针对超生行为本身的，与是否进行亲子关系证明无关。
社会抚养费征收：超生者需要按照当地的规定缴纳社会抚养费，这是对超生行为的一种经济处罚。
其他行政处罚：在特定情况下，超生者还可能面临其他行政处罚，如工作单位的纪律处分等，但这取决于具体的工作单位规定和当地政策。
三、当前政策环境下的考虑
需要注意的是，随着计划生育政策的调整，现在对于生育行为的限制已经大大放宽。在很多地区，已经取消了社会抚养费的征收，或者对超生行为的处罚力度已经大大减轻。因此，在考虑超生可能面临的处罚时，需要结合当前的政策环境来具体分析。
四、建议与提醒
了解当地政策：如果你对超生可能面临的处罚有疑问，建议先了解当地的计划生育政策和社会抚养费征收规定。
合法生育：为了避免不必要的麻烦和处罚，建议遵守当地的计划生育政策，合法生育子女。
咨询专业人士：如果你对亲子关系证明或超生处罚有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。
总之，做亲子关系证明本身并不会因为超生而直接导致处罚，但超生行为本身可能会面临相应的行政处罚措施。在处理这类问题时，建议结合当前的政策环境和个人情况来具体分析，并寻求专业的法律帮助。