劳动合同中给员工确定的工资，一般指的是应发工资，而非实发工资。以下是对这一问题的详细解释：

一、应发工资与实发工资的定义

1. 应发工资：这是劳动者在正常出勤、完成工作任务等情况下，根据劳动合同约定和单位薪酬制度应当获得的工资总额。它包括了基本工资、绩效工资、加班工资、奖金、津贴、补贴等所有税前收入。

2. 实发工资：这是劳动者实际到手的工资数额，它是在应发工资的基础上扣除一些法定或约定的项目后得出的。这些扣除项目通常包括社会保险个人缴费部分、住房公积金个人缴费部分、个人所得税以及其他合法扣款（如因劳动者个人原因给单位造成经济损失，按规定需赔偿的款项，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准）。

二、劳动合同中工资条款的解读

在劳动合同中，工资条款通常会明确约定劳动者的应发工资数额或计算方式。这是因为应发工资是劳动者劳动报酬的完整体现，也是计算社会保险、住房公积金等缴费基数的基础。而实发工资则因个人情况（如出勤、绩效、扣款等）而异，无法在劳动合同中一一列明。

三、实发工资的计算方法

实发工资的计算涉及多个因素，以下是一个简化的计算公式：

实发工资 = 应发工资 - 五险一金个人缴纳部分 - 个人所得税 - 其他代扣款项

其中：

• 五险一金个人缴纳部分：包括养老保险、医疗保险、失业保险、住房公积金的个人缴费比例（具体比例因地区政策而异）。
• 个人所得税：根据应纳税所得额（应发工资-起征点5000元-五险一金扣除项）适用税率表计算。
• 其他代扣款项：如企业垫付的水电费、工会会费等，需根据具体协议扣除。

四、实例说明

假设某员工月工资结构如下：

• 基本工资：5000元
• 绩效奖金：2000元
• 五险一金个人缴纳：1071元（以北京为例，假设缴费基数为7000元，具体比例根据当地政策）
• 无其他代扣款项

计算过程：

1. 应发工资：5000 + 2000 = 7000元
2. 应纳税所得额：7000 - 5000 - 1071 = -71元（低于起征点，个税为0）
3. 实发工资：7000 - 1071 - 0 = 5929元

五、注意事项

1. 地区差异：五险一金缴费基数和比例因地区政策而异，需以当地规定为准。
2. 企业特殊规定：部分企业可能提供补充公积金、商业保险等福利，需单独核算扣除金额。
3. 税务合规性：企业必须依法代扣代缴个人所得税，员工可通过“个人所得税APP”核验明细。

六、争议处理建议

若发现实发工资与约定不符，员工可采取以下步骤：

1. 核对工资条明细，确认各项扣除是否合规；
2. 与人力资源部门沟通，要求解释差异原因；
3. 必要时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

综上所述，劳动合同中给员工确定的工资一般指的是应发工资。员工在签订劳动合同时，应仔细阅读工资条款，了解应发工资的构成和计算方式，以及可能涉及的扣款项目。如有任何疑问或争议，应及时向用人单位咨询或寻求法律援助。