母公司签订的协议对全资子公司的相关约定是否有效，需根据具体情况判断，一般而言，若协议内容合法且不违反子公司章程或法律规定，且子公司明确接受或实际履行了协议，则相关约定对子公司有效。以下从不同角度进行详细分析：

一、协议效力的一般原则

1. 合同相对性原则：

   • 原则上，合同仅对签订合同的双方具有约束力。母公司签订的协议，其效力通常仅及于母公司和协议的另一方当事人，而不直接及于全资子公司。

2. 协议内容的合法性：

   • 若协议内容合法，不违反法律、行政法规的强制性规定，且不违背公序良俗，则协议本身具有法律效力。

二、对全资子公司有效的情形

1. 子公司明确接受协议：

   • 如果全资子公司通过书面形式或其他明确方式表示接受母公司签订的协议中的相关约定，那么这些约定对子公司具有约束力。

2. 子公司实际履行协议：

   • 即使子公司没有明确表示接受协议，但如果其实际履行了协议中的相关义务或享受了相关权利，可以视为子公司以实际行动接受了协议的约束。

3. 协议涉及子公司利益且子公司未反对：

   • 如果协议中的相关约定涉及子公司的利益，且子公司知道或应当知道该约定但未提出反对意见，也可以视为子公司接受了该约定的约束。特别是在母公司作为子公司唯一股东的情况下，子公司往往难以对母公司的决策提出有效反对。

4. 法律特别规定或公司章程允许：

   • 在某些特定情况下，法律可能特别规定母公司签订的协议对子公司具有约束力，或者公司章程可能允许母公司代表子公司签订协议。

三、对全资子公司无效的情形

1. 子公司明确拒绝协议：

   • 如果全资子公司明确表示不接受母公司签订的协议中的相关约定，那么这些约定对子公司不具有约束力。

2. 协议内容违反子公司章程或法律规定：

   • 如果协议中的相关约定违反了子公司的章程或法律、行政法规的强制性规定，那么这些约定对子公司无效。

3. 子公司未实际参与协议签订且未受益：

   • 如果子公司既未实际参与协议的签订，也未从协议中受益，且没有明确表示接受协议的约束，那么协议中的相关约定对子公司通常不具有约束力。

四、实际操作建议

1. 审查协议内容：

   • 在签订涉及全资子公司的协议时，应仔细审查协议内容，确保不违反子公司的章程或法律规定，并明确约定协议对子公司的约束力。

2. 获得子公司明确同意：

   • 如果可能的话，应获得全资子公司的明确同意或书面确认，以确保协议中的相关约定对子公司具有约束力。

3. 咨询专业律师：

   • 在涉及复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。虽然此处我作为张超律师已经给出了全面的分析，但具体案件仍需具体分析，以确保法律适用的准确性和有效性。

如有任何进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。