若烟草被查但未抓到涉案人员，执法部门通常会根据具体情况采取以下处理措施：

1. 对烟草的处置
   执法部门会依法对查获的烟草进行扣押或没收。根据《烟草专卖法》及其实施条例，无证运输、销售烟草制品属于违法行为，查获的烟草可能被直接没收并销毁，或通过法定程序拍卖（需符合特定条件）。若烟草来源合法（如正规渠道进货但未办理运输许可），可能仅面临行政处罚，烟草本身可能被返还（需补办手续）。

2. 对涉案人员的追责

   • 行政处罚：若执法部门通过监控、物流记录等证据锁定涉案人员（如货主、运输者），即使未当场抓获，仍可依法对其处以罚款、没收违法所得等行政处罚。例如，无烟草专卖零售许可证经营烟草制品零售业务的，可能被处以违法经营总额20%-50%的罚款。
     
   • 刑事追责：若涉案金额较大（如非法经营数额达5万元以上），或存在伪造、买卖许可证等严重情节，可能构成非法经营罪。执法部门会立案侦查，通过技术手段追踪涉案人员，后续可能采取网上追逃、通缉等措施。

3. 对上下游环节的调查
   执法部门会顺藤摸瓜，调查烟草的来源（如生产厂家、批发商）和去向（如下游零售商、消费者）。若发现其他环节存在违法行为（如生产假烟、销售走私烟），会同步立案处理，形成全链条打击。

建议：

• 若您是涉案人员或相关方，应主动配合调查，说明烟草来源、运输目的等关键信息，避免因隐瞒导致处罚加重。
  
• 若您认为执法程序存在瑕疵（如查扣手续不全、证据不足），可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护合法权益。
  

如有具体案件细节（如查扣地点、烟草数量、涉案金额等），可进一步向我咨询，我会结合法律条文和实务经验为您分析。