公司印章在以下情况下通常会被封存：
公司业务终止或清算：当公司决定终止业务或进入清算阶段时，为了防止印章被非法使用或滥用，确保公司资产和权益的安全，公司印章通常会被封存。这是公司结束运营过程中的一项重要法律措施。
公司重组或合并：在公司进行重组、合并或分立等重大变更时，为了理清各方权益，避免印章使用上的混乱和纠纷，公司可能会选择封存印章，待重组或合并完成后，再根据新的公司结构和规定重新启用或刻制新的印章。
涉及重大法律纠纷：当公司涉及重大法律诉讼或被查封时，为了防止印章被用于非法目的或损害公司利益，司法机关或相关执法部门可能会要求公司封存印章，作为保全措施的一部分。
公司内部管理需要：在某些情况下，公司可能出于内部管理需要，如防止印章被盗用、滥用或误用，也会选择封存印章。这通常发生在公司发现印章管理存在漏洞或风险时，作为加强内部控制和风险管理的一种措施。
封存流程与注意事项：
明确封存原因与决策：公司需有合理且明确的印章封存原因，并由公司的法定代表人或相关权力机构（如董事会、股东会）作出封存印章的正式决策。
盘点与准备：对公司所有需要封存的印章进行全面盘点，明确印章的种类、数量和状态，并准备好封存所需的工具和材料，如印泥、封存袋（盒）、标签纸等。
执行封存：在至少两名见证人在场的情况下，执行封存操作，包括在封存记录本上加盖印章印鉴、将印章放入封存袋（盒）中并贴上标签、拍照记录等。
记录与备案：详细记录封存过程，包括封存的原因、时间、地点、参与人员、印章种类及数量等信息，并由所有参与人员签字确认。将封存记录和相关文件提交给公司档案管理部门或指定负责人进行备案保存。
后续管理：制定严格的保管制度，规定保管场所和保管人员的职责，限制印章的使用权限，并定期对封存的印章进行检查，确保封存状态完好无损。
解封程序：当封存印章的原因消除后，需要经过公司决策机构的审批，并办理相关的手续，才能对印章进行解封。
法律建议：
在整个封存过程中，公司应严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保操作的合法性和有效性。
不同地区可能会根据自身情况制定不同的印章封存流程和要求，因此在进行印章封存时，建议公司咨询专业法律人士（如我），以确保操作符合当地法律法规和公司规定。
如果公司印章被封存后，因特殊原因需要使用印章，必须经过公司决策机构或相关负责人的审批，并办理相应的使用手续。使用后，要及时将印章重新封存，并记录使用情况。
如有任何关于公司印章封存或其他公司法务方面的疑问，欢迎直接向我咨询。