员工生病请假是否扣工资，需根据具体情况来判断，主要包括是否处于法定医疗期内、是否履行了请假手续以及公司规定和劳动合同的约定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法定医疗期内

   • 医疗期定义：根据劳动法相关规定，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
   • 工资支付标准：在规定的医疗期间内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。例如，若当地月最低工资标准为2000元，则病假工资最低不得低于1600元。具体支付标准可能因地区和工作年限而异，如某些地区会根据员工的工作年限来确定支付比例。

2. 超过法定医疗期

   • 若员工超过法定医疗期仍不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可解除劳动合同，但需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资，并支付经济补偿。经济补偿金按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。
   • 在此情况下，若员工未提供劳动，用人单位无需按病假工资标准支付工资。但在解除劳动关系手续办理完毕前，双方劳动关系仍然存续，用人单位应按当地规定处理相关待遇。若员工病愈后能够回到工作岗位继续工作，对于正常出勤的部分，公司应当按照正常工资标准支付工资。

3. 未履行请假手续

   • 如果员工生病但未按照公司规定的流程履行请假手续，公司可能会按照旷工处理。旷工期间，公司通常不支付工资。若旷工情况严重违反公司规章制度，公司还有权解除劳动合同。但公司的规章制度必须是合法制定且经过公示的，否则对员工不具有约束力。

4. 公司规定与劳动合同

   • 除了法律规定外，公司规定和劳动合同中的相关条款也会影响病假期间的工资支付。因此，在处理此类问题时，还需仔细审查公司规定和劳动合同的具体内容。例如，劳动合同中可能明确约定了病假期间的工资支付标准，或者公司规章制度中可能规定了病假工资的支付比例和条件。

建议：

• 对于员工而言，在生病请假时，应遵守公司规定，及时履行请假手续，并了解自己的权益和公司规定，以便在需要时能够正确维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应制定合法、合理的病假工资支付政策，并明确告知员工，以避免因误解或信息不对称而产生不必要的纠纷。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。