企业法人扣12分这一表述，在常规法律语境下并不直接对应一个明确的法律后果，因为“扣分”通常与驾驶证、交通违规等场景相关联，而非直接针对企业法人。不过，若将此问题理解为企业法人因某种违法行为导致其信用或资质评分被扣除12分，那么我们可以从企业信用和资质管理的角度来探讨可能的后果。
企业信用受损：
- 在许多国家和地区，企业都有信用评级或信用记录系统。如果企业法人因违法行为（如税务违规、环保不达标、合同欺诈等）导致企业信用评分被大幅扣除，这将直接影响企业的信用状况。
- 信用受损可能导致企业在融资、招标、政府采购等方面受到限制或歧视，增加企业的运营成本和风险。
资质受限或吊销：
- 对于某些特定行业或业务，企业需要获得相应的资质或许可才能经营。如果企业法人因违法行为导致企业资质评分被扣除12分，可能触发资质受限或吊销的机制。
- 例如，在建筑行业，如果企业因安全事故或违规操作被扣除大量信用分，可能导致其建筑资质被暂停或吊销，从而无法继续承接工程项目。
行政处罚：
- 除了信用和资质方面的后果外，企业法人还可能因违法行为受到行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停产停业等。
- 这些处罚的严重程度取决于违法行为的性质和后果，以及相关法律法规的规定。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果企业法人的违法行为构成犯罪（如贪污、受贿、诈骗等），那么除了上述行政后果外，还可能面临刑事责任的追究。
- 刑事责任包括有期徒刑、罚金等，对个人和企业的声誉和未来运营都将产生极其严重的影响。
针对企业法人的建议：
- 遵守法律法规：企业法人应严格遵守国家法律法规和行业规范，确保企业合法合规经营。
- 加强内部管理：建立健全企业内部管理制度，加强对员工的教育和培训，提高法律意识和风险防范能力。
- 关注信用和资质：定期关注企业的信用评级和资质状况，及时发现问题并采取措施进行整改。
- 寻求法律帮助：如果企业面临法律纠纷或风险，应及时寻求专业律师的帮助，以维护企业的合法权益。
若您具体指的是某种特定情境下的“扣分”制度（如特定行业内的信用评价、招投标评分等），那么后果将取决于该制度的具体规定。在这种情况下，建议您详细查阅相关规章制度或咨询相关行业主管部门，以获取更准确的信息。
总之，企业法人扣12分的后果取决于具体的违法情境和法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。