施工许可证自行废止的法律后果主要包括项目无法合法继续施工、可能面临行政处罚以及需要重新办理施工许可等。以下是对这些法律后果的详细分析：

1. 项目无法合法继续施工：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》及相关法规，施工许可证是建设项目合法开工的重要凭证。一旦施工许可证自行废止，意味着该建设项目失去了合法开工的依据，因此无法继续合法施工。
   • 例如，如果建设单位未能在领取施工许可证后的三个月内开工，且未申请延期或超过延期次数、时限，施工许可证将自行废止。此时，若建设单位继续施工，将构成违法施工行为。

2. 可能面临行政处罚：

   • 对于违法施工行为，相关行政主管部门有权依法对建设单位进行行政处罚。处罚措施可能包括罚款、责令停工、吊销施工许可证（如已重新办理）等。
   • 具体处罚力度会根据违法情节的严重程度、造成的后果以及相关法律法规的规定来确定。例如，如果违法施工行为导致了安全事故或环境污染等严重后果，建设单位可能面临更严厉的行政处罚。

3. 需要重新办理施工许可：

   • 如果建设单位希望继续施工，必须重新办理施工许可证。重新办理施工许可证需要满足相关法规规定的条件，并提交必要的申请材料。
   • 重新办理施工许可证的过程可能涉及多个环节和部门，需要耗费一定的时间和精力。同时，如果建设单位在之前的施工过程中存在违法违规行为，还可能影响重新办理施工许可证的审批结果。

法律建议：

• 建设单位应严格遵守施工许可证的有效期规定，确保在规定时间内开工或按时申请延期。如果因故无法按时开工，应及时向发证机关报告并说明原因，申请延期或采取其他合法措施。
• 在建工程项目若因故中止施工，建设单位应及时向发证机关报告，并按照规定程序进行审查和恢复施工的准备。避免长期停工导致施工许可证废止和项目无法继续施工的风险。
• 如果施工许可证已经自行废止，建设单位应立即停止施工行为，并尽快咨询专业律师或相关行政主管部门，了解重新办理施工许可证的具体要求和流程，以便尽快恢复施工。

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