您好，关于公司股权转让后原来签订的协议如何履行的问题，这是一个涉及多方权益和多个法律环节的复杂过程。下面我将为您详细阐述履行的步骤及注意事项：
一、明确协议条款
审查协议内容：
- 您需要仔细审查股权转让协议，确保其中明确了转让方与受让方的基本信息、股权转让的具体比例或数量、转让价格及支付方式、交割时间、双方的权利义务等关键条款。
确认无歧义：
- 对协议中的任何模糊或不明确之处，您应及时与对方进行沟通并澄清，以避免在后续履行过程中产生争议。
二、支付转让价款
按约定支付：
- 受让方应严格按照协议约定的时间和方式向转让方支付股权转让价款。支付方式可以是现金、银行转账或其他双方认可的方式。
保留凭证：
- 支付完成后，受让方务必妥善保管支付凭证，如银行转账记录、收据等，以备后续查验和证明支付事实。
三、办理工商变更登记
提交申请：
- 转让方和受让方需共同向公司登记机关提交股权转让的变更登记申请，并附上相关材料，如股权转让协议、股东会决议、公司章程修正案等。
审核通过：
- 公司登记机关会对提交的材料进行审核。审核通过后，会办理股权变更登记手续，将受让方的姓名或名称记载于公司的股东名册，并视情况换发新的营业执照。
四、公司内部程序
修改公司章程：
- 根据股权转让的情况，公司应对章程进行相应的修改，以反映新的股权结构。
通知其他股东：
- 如果公司是有限责任公司，转让方应书面通知其他股东征求同意（如协议签订前未履行该程序）。其他股东在同等条件下有优先购买权。若其他股东放弃优先购买权，则股权转让可继续进行。
出具出资证明书：
- 公司应向受让方签发出资证明书，确认其股东身份和持股比例。
更新股东名册：
- 将受让方的信息添加到公司的股东名册中，作为股东资格的证明。
五、交接与过渡
资产与资料交接：
- 转让方应将与目标股权相关的公司资产、文件、资料等移交给受让方，确保受让方能够顺利接手并管理目标股权。
过渡期安排：
- 在股权转让完成前，双方可以协商确定一个过渡期。在此期间，转让方可以继续管理公司或协助受让方熟悉公司业务。过渡期内，转让方应确保公司的正常运营，不得做出损害公司或受让方利益的行为。
六、履行附随义务
保密义务：
- 双方应对在股权转让过程中知悉的商业秘密、技术秘密等予以保密，未经对方同意不得向第三方披露。
竞业禁止义务：
- 如果协议中有约定，转让方在一定期限内可能不得从事与公司业务相竞争的活动。
七、争议解决
协商解决：
- 如果在履行股权转让协议过程中发生争议，双方应首先尝试通过友好协商解决。
法律途径：
- 协商不成的，任何一方均有权向有管辖权的人民法院提起诉讼或按照协议约定的仲裁条款申请仲裁。
综上所述，公司股权转让后原来签订的协议的履行是一个复杂而细致的过程。双方应严格按照协议约定履行各自义务，并确保所有法律程序得到妥善执行。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询专业律师或相关机构。