针对您提出的“私营企业公款私存如何处理”的问题，这是一个涉及财务与法律层面的重要议题，需要我们从多个维度进行综合分析和应对。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律层面分析
挪用资金罪：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条，公司、企业工作人员若利用职务便利，挪用本单位资金归个人使用或借贷他人，且数额较大、超过三个月未还，或进行营利活动、非法活动的，将面临三年以下有期徒刑至七年以上有期徒刑的刑罚。
- 实例：若企业财务人员私自将公司资金用于个人投资或消费，且长时间未归还，即可能构成此罪。
职务侵占罪：
- 法律依据：依据《刑法》第二百七十一条，以非法占有为目的，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，将面临三年以下至十年以上有期徒刑，并处罚金。
- 实例：若企业管理人员通过虚报费用、伪造合同等手段，将公司资金据为己有，即属于此类犯罪。
法律程序：
- 一旦发现公款私存行为，企业应立即向公安机关报案，由公安机关立案并展开调查，收集证据。
- 案件随后移送检察机关审查，决定是否提起公诉；最终由法院根据证据进行审理判决。
二、企业内部管理层面应对
立即内部调查：
- 企业应迅速启动内部调查程序，详细审查财务记录、交易凭证和账户信息，以明确公款私存的具体情况和金额。
- 妥善保存所有相关证据，以备后续法律程序或纪律处分使用。
追回被挪用资金：
- 与涉事人员协商还款事宜，或通过法律途径追讨被挪用的资金，确保资金及时回归企业账户。
- 若涉事人员拒不还款，企业可依法向法院提起诉讼，要求其返还资金并赔偿损失。
纪律处分与法律措施：
- 根据企业内部规章制度，对涉事人员给予相应的纪律处分，如警告、降职、辞退等。
- 若公款私存行为构成犯罪，企业应依法向公安机关报案，并配合司法机关进行调查和审判工作。
建立健全规章制度：
- 明确资金使用审批流程与权限，制定严格的财务管理制度，防止管理漏洞和违规行为的发生。
- 例如，可以设定不同金额级别的审批流程，确保资金使用的合规性和透明度。
加强监督与审计：
- 设立内部审计部门或聘请外部审计机构，定期对企业财务进行审计，及时发现并纠正违规行为。
- 鼓励员工积极举报违法违规行为，并提供保护机制，确保举报人的合法权益不受侵害。
持续预防与改进：
- 通过加强内部控制和监管机制，提高财务管理水平，降低财务风险。
- 定期对员工进行法律意识和职业道德培训，构建诚信企业文化，从源头上预防公款私存等违规行为的发生。
三、综合建议
- 法律与内部管理并重：处理私营企业公款私存问题，需要法律手段与企业内部管理相结合，形成有效的防控体系。
- 及时行动：一旦发现公款私存行为，企业应迅速采取行动，追回资金、严惩违规者，并加强内部管理，防止类似事件再次发生。
- 持续改进：企业应不断总结经验教训，完善财务管理制度和内部控制机制，提高财务管理水平，确保企业的健康发展和股东利益的保护。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。