结论前置：员工因不能胜任工作被辞退时，是否有赔偿以及赔偿的具体金额，取决于多种因素，包括是否在试用期内、用人单位是否提供了适当的培训或调整了工作岗位、以及解除劳动合同的程序是否合法等。下面我将从不同情况为您详细分析。
一、试用期内的解除与赔偿
法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第一项，若员工在试用期内被证明不符合录用条件（如不能胜任工作），用人单位可以辞退劳动者而无需支付经济补偿金。
分析：在试用期内，用人单位对员工的考察较为严格，若员工确实不能胜任工作，且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任，用人单位有权解除劳动合同，且无需支付经济补偿。但这一过程需要用人单位提供充分的证据证明员工不能胜任工作，并经过培训或调整工作岗位。
二、试用期外的解除与赔偿
合法解除与经济补偿：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第二项，员工过了试用期后，若不能胜任工作，且经过培训或者调整工作岗位仍不能胜任，用人单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同。同时，根据该法第四十六条，用人单位在此种情况下解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。
- 经济补偿计算：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
- 举例：员工小李在某公司工作了3年零4个月，月平均工资为8000元。若公司以小李不能胜任工作且经过培训后仍不能胜任为由合法解除劳动合同，则需向小李支付3.5个月工资的经济补偿，即28000元。若公司未提前三十日书面通知，还需额外支付一个月工资8000元。
违法解除与赔偿金：
- 法律依据：如果用人单位无法证明劳动者不能胜任工作，或者未对不能胜任工作的劳动者进行培训或调整工作岗位，就直接以不能胜任工作为由辞退员工，这构成违法解除劳动合同。根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，用人单位应依照该法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 举例：若公司无任何证据证明小张不能胜任工作就直接将其辞退，则属于违法解除劳动合同。假设小张工作了2年零2个月，月平均工资为6000元，那么赔偿金将为经济补偿（2.5×6000=15000元）的二倍，即30000元。
三、特殊情况下的责任
- 如果劳动者不能胜任工作是由于用人单位未提供适当的培训或劳动条件造成的，用人单位在解除劳动合同时可能需要承担更大的责任，包括但不限于支付额外的经济补偿或赔偿金。
四、建议与注意事项
- 保留证据：无论是用人单位还是劳动者，都应保留好与不能胜任工作、培训、调岗、解除劳动合同等相关的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、培训记录、调岗通知等。
- 协商沟通：在解除劳动合同前，用人单位应与员工进行充分沟通，明确不能胜任工作的具体原因，并尝试提供培训或调岗机会。员工也应积极配合用人单位的安排，努力提升自身能力以适应岗位要求。
- 签订协议：双方就赔偿事宜达成一致后，应签订书面的解除劳动合同协议书，明确赔偿金额、支付方式及时间等条款。协议书应具有法律效力，双方应妥善保管。
- 及时咨询：若面临此类情况，劳动者或用人单位如有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律意见和帮助。
综上所述，员工因不能胜任工作被辞退时的赔偿问题需根据具体情况判断。希望以上分析能对您有所帮助。