您好，关于二级法人企业公章是否有编码的问题，这主要取决于公章的刻制时间以及当地的具体管理规定。
首先，需要明确的是，公章编码并非所有公章都必然具备的特征。以安徽省为例，根据安徽省公安厅的回复，2016年之前刻制的企业公章是无编码的。这是因为在此之前，并未全面实施部颁标准印章编码制度。而自2016年起，随着印章业治安管理信息系统的陆续建成，新刻制的公章开始制作防伪编码，以增强公章的安全性和可追溯性。
对于二级法人企业而言，其公章的编码情况同样遵循上述规律。如果该企业的公章是在2016年之前刻制的，那么很可能没有编码；如果是在此之后刻制的，则应该具备编码。
此外，要鉴别无编码企业公章的真伪，您可以采取以下措施：
直接赴相关企业核实：这是最直接且有效的方法。通过与企业相关人员面对面沟通，您可以确认公章的真实性和有效性。
携带单位介绍信赴该公司所属辖区治安大队查询：治安大队作为印章业治安管理的主管部门，拥有印章业治安管理信息系统，可以查询公章的备案信息，从而帮助您鉴别公章的真伪。
至于您提到的《组织机构统一社会信用代码管理办法》，该办法主要规范的是组织机构统一社会信用代码的管理工作，与公章编码无直接关联。统一社会信用代码是组织机构在全国范围内唯一的、终身不变的身份标识码，标注于营业执照上，用于市场监管、行政许可、信用监管等多个领域。但它并不直接决定公章是否具备编码。
综上所述，二级法人企业公章是否有编码取决于公章的刻制时间和当地的具体管理规定。如果您需要鉴别无编码公章的真伪，建议采取上述提到的两种方法进行核实。希望这些解答能对您有所帮助。