公司被起诉且凭证被销毁，确实会对审计工作产生重大影响，但并非无法应对。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 凭证销毁对审计的直接影响：

   • 审计工作的基础是公司的财务记录和凭证。凭证的销毁意味着审计师无法直接获取这些关键证据，从而难以对公司的财务状况进行准确评估。
   • 凭证的缺失可能导致审计师无法确认某些交易的真实性、准确性和完整性，进而影响审计报告的可靠性和公正性。

2. 应对策略与法律建议：

   • 立即采取补救措施：公司应尽快采取措施，尽可能恢复或重建被销毁的凭证。这可能包括从备份系统中恢复数据、联系相关交易方获取交易记录等。
   • 与审计师沟通：公司应主动与审计师沟通，说明凭证被销毁的情况，并提供所有可用的替代证据。审计师可能会根据具体情况调整审计程序，以适应这种特殊情况。
   • 考虑法律后果：凭证的销毁可能涉及违法行为，如故意销毁会计凭证、会计账簿等。公司应评估这种行为可能带来的法律后果，并考虑采取必要的法律措施来减轻或避免这些后果。根据《中华人民共和国会计法》的相关规定，故意销毁会计凭证、会计账簿等行为可能会受到行政处罚，甚至可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
   • 加强内部控制：为防止类似事件再次发生，公司应加强内部控制，确保财务记录的完整性和安全性。这可能包括建立更严格的凭证管理制度、加强员工培训等。

3. 审计调整与替代程序：

   • 在凭证缺失的情况下，审计师可能会采用替代程序来进行审计。例如，审计师可能会更多地依赖外部证据、分析性程序等来评估公司的财务状况。
   • 公司应积极配合审计师的替代程序，提供所有必要的协助和支持。这有助于审计师更准确地评估公司的财务状况，并减少因凭证缺失而带来的审计风险。

4. 法律风险与合规建议：

   • 公司应认识到凭证销毁可能带来的法律风险，并采取积极措施来降低这些风险。这包括与审计师合作、加强内部控制、考虑法律后果等。
   • 如果公司面临法律诉讼或监管调查，应寻求专业法律帮助，以确保公司的权益得到充分保护。

总结与进一步行动建议：公司被起诉且凭证被销毁确实会对审计工作产生重大影响。然而，通过采取补救措施、与审计师沟通、考虑法律后果以及加强内部控制等策略，公司可以应对这一挑战。如果公司面临复杂的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我将根据公司的具体情况提供专业的法律帮助。