《全民所有制工业企业法》废止后，相关法律适用问题需结合具体场景，依据现行有效法律及政策处理，核心适用规则如下：

1. 企业设立与组织形式：适用《公司法》或《企业国有资产法》

• 若企业改制为有限责任公司/股份有限公司：
  原全民所有制企业改制为《公司法》下的公司制企业后，直接适用《公司法》关于股东权利、公司治理、股权转让等规定。例如，原企业职工持股会或工会代持的股权，需按《公司法》及国资监管政策规范为自然人或法人持股。
• 若企业未改制仍为全民所有制企业：
  根据《企业国有资产法》及国务院相关政策，此类企业由国务院或地方政府代表国家履行出资人职责，适用《企业国有资产法》中关于国有资产监督管理、企业重大事项决策（如合并、分立、解散）等规定。

2. 企业经营管理：优先适用《民法典》合同编与国资监管政策

• 日常经营合同：
  原《全民所有制工业企业法》中关于企业采购、销售、租赁等合同的规定已被《民法典》合同编吸收。例如，企业签订买卖合同时，需遵循《民法典》第597条（无权处分合同效力）、第621条（质量瑕疵担保责任）等条款。
• 国资特殊监管要求：
  涉及国有资产转让、重大投资、担保等行为时，需同时符合《企业国有资产交易监督管理办法》（国资委令第32号）等政策。例如，国有独资企业对外担保需经国资监管机构批准，否则可能因违反程序导致担保无效。

3. 劳动用工：适用《劳动合同法》及国企专项政策

• 劳动合同管理：
  原法律中关于职工招聘、劳动合同签订、解除等规定已被《劳动合同法》替代。例如，企业单方解除劳动合同需符合《劳动合同法》第39条（过错性解除）、第40条（无过错性解除）等条件，否则可能构成违法解除需支付赔偿金。
• 国企特殊规定：
  涉及职工安置、内退、经济补偿金计算等问题时，需结合《国务院关于国有企业富余职工安置规定》及地方政策处理。例如，企业改制时职工安置方案需经职工代表大会审议通过，否则可能引发群体性纠纷。

4. 解散与清算：适用《公司法》或《企业破产法》

• 企业改制后解散：
  若企业已改制为有限责任公司，解散清算程序按《公司法》第183条（解散原因）、第184条（清算组组成）等规定执行，清算组需在成立后10日内通知债权人，并在60日内公告。
• 未改制企业破产：
  若企业符合《企业破产法》第2条（不能清偿到期债务且资产不足以清偿全部债务）条件，可申请破产清算。此时需优先清偿职工工资、社保费用等优先债权，再清偿普通债权。

5. 历史遗留问题：结合政策与司法解释处理

• 土地使用权处置：
  原全民所有制企业使用的划拨土地，改制时需按《国有企业改革中划拨土地使用权管理暂行规定》处理，可采取出让、租赁、作价出资等方式处置，否则可能因土地权属不清导致企业资产贬值。
• 职工住房分配：
  涉及房改房、集资建房等历史问题时，需结合《国务院关于深化城镇住房制度改革的决定》及地方房改政策处理。例如，职工已按房改政策购买公房的，企业不得收回或要求补缴房款。

提示：法律适用需结合企业改制文件、国资监管批复等具体材料分析。若涉及复杂问题（如国有资产流失追责、职工安置方案合法性审查），建议提供详细背景后进一步咨询，我将结合具体场景为您梳理风险点及应对方案。