针对您提出的“非营运小型客车疲劳驾驶单位怎么处理的”这一问题，首先需要明确的是，虽然您提到的是“非营运小型客车”，但疲劳驾驶的相关规定及处理原则在各类机动车中是相通的，只是具体处罚措施可能因车辆类型及使用性质有所不同。以下我将基于一般性的法律规定和原则，结合非营运小型客车的实际情况，为您详细解答。
一、法律依据与疲劳驾驶认定
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例，疲劳驾驶被明确定义为连续驾驶机动车超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟的行为。这一规定不仅适用于营运车辆，同样适用于非营运车辆，包括非营运小型客车。
二、单位（或车主/驾驶员）应承担的责任与处理措施
内部管理责任：
- 如果非营运小型客车属于单位所有或管理，单位应建立健全的车辆管理制度，明确禁止疲劳驾驶，并对驾驶员进行相关的安全教育和培训。
- 单位应定期检查驾驶员的驾驶记录，确保驾驶员遵守交通法规，不出现疲劳驾驶等违法行为。
驾驶员个人责任：
- 驾驶员作为直接操作车辆的人员，应自觉遵守交通法规，合理安排作息时间，确保在驾驶过程中保持清醒和警觉。
- 若驾驶员因疲劳驾驶被查处，将面临相应的法律处罚，同时可能影响其个人驾驶记录和信誉。
具体处罚措施（针对驾驶员）：
- 扣分：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶其他机动车（包括非营运小型客车）连续驾驶超过4小时未停车休息或停车休息时间少于20分钟的，一次记3分。
- 罚款：依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，可处警告或者二十元以上二百元以下罚款。具体金额由地区根据实际情况确定，但通常不会超过200元。
单位可能面临的间接影响：
- 如果单位车辆频繁出现疲劳驾驶等违法行为，可能会影响单位的声誉和形象。
- 在某些情况下，如果单位未能尽到管理责任，导致驾驶员疲劳驾驶引发事故，单位可能还需承担相应的民事赔偿责任或管理责任。
三、预防与建议
- 加强安全教育：单位应定期对驾驶员进行安全教育和培训，提高驾驶员的安全意识和法律意识。
- 合理安排工作：单位应合理安排驾驶员的工作时间和休息时间，避免驾驶员长时间连续驾驶。
- 利用科技手段：单位可以考虑安装智能监控设备，实时监测驾驶员的驾驶状态，及时发现并纠正疲劳驾驶行为。
- 鼓励举报与监督：单位可以建立举报机制，鼓励员工和公众举报疲劳驾驶行为，形成全社会共同抵制疲劳驾驶的良好氛围。
综上所述，非营运小型客车疲劳驾驶的处理主要涉及驾驶员个人的法律处罚和单位的管理责任。单位应加强内部管理，提高驾驶员的安全意识，共同营造一个安全、有序的道路交通环境。