诊所未经许可销售含麻黄碱类药品的，将面临行政处罚乃至刑事处罚，具体处罚取决于违法情节的严重程度。以下是详细分析：

1. 行政处罚层面
   根据《中华人民共和国药品管理法》及《麻醉药品和精神药品管理条例》，含麻黄碱类复方制剂属于国家严格管控的药品。若诊所存在以下行为，将面临药品监督管理部门的处罚：
   

• 未取得经营资质：若诊所未取得《药品经营许可证》或超出诊疗范围销售含麻药品，可能被没收违法所得，并处违法销售药品货值金额15倍以上30倍以下的罚款（货值金额不足10万元的按10万元计算）；情节严重的，吊销《医疗机构执业许可证》。
  
• 未按规定渠道采购或销售：若诊所从非法渠道购进含麻药品，或未凭医师处方销售（如零售给个人），可能被警告、没收违法所得，并处2万元以上5万元以下罚款；情节严重的，责令停业整顿直至吊销执业许可。
  
• 记录造假或未备案：若未按规定建立真实完整的购销记录，或未向药品监督管理部门备案，可能被责令改正，给予警告；逾期不改正的，处5000元以上2万元以下罚款。

1. 刑事处罚层面
   若诊所存在以下行为，可能构成犯罪，依法追究刑事责任：
   

• 非法经营罪：根据《刑法》第225条，若诊所未经许可经营含麻药品，扰乱市场秩序，情节严重的（如违法所得数额达5万元以上，或曾因同类行为受过处罚又实施等），处5年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得1倍以上5倍以下罚金；情节特别严重的，处5年以上有期徒刑，并处违法所得1倍以上5倍以下罚金或没收财产。
  
• 贩卖毒品罪：若诊所明知购买者将含麻药品用于提炼毒品，仍向其销售，或销售数量达到毒品犯罪标准（如麻黄碱400克以上），可能以贩卖毒品罪论处，最高可处死刑（具体量刑需结合毒品纯度、数量等情节）。

1. 其他法律后果
   

• 信用惩戒：违法信息可能被纳入国家企业信用信息公示系统，影响诊所的资质审批、政府采购等。
  
• 民事赔偿：若因销售含麻药品导致患者健康损害，诊所需承担医疗损害赔偿责任。

建议：诊所应严格遵守以下合规要求：

1. 确保含麻药品仅用于医疗目的，凭医师处方调配；
   
2. 从合法渠道采购，建立真实完整的购销记录；
   
3. 定期自查库存，防止药品流失；
   
4. 对员工进行法律培训，避免因无知导致违法。
   

若您遇到具体案件或需要进一步分析，可直接向我咨询，我会结合细节提供针对性建议。