在二审期间发现危险作业罪的，一般需结合案件具体情况，区分不同处理方式，具体如下：

1. 若危险作业罪与原案存在关联，可能并案处理
   若二审期间发现的危险作业罪与原一审案件属于同一犯罪事实或存在牵连关系（例如原案为重大责任事故罪，二审发现行为人同时构成危险作业罪），法院可能根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，将危险作业罪并入原案审理。此时，二审法院会综合全案证据，对两罪一并审查，可能撤销原判、发回重审，或直接改判（如数罪并罚）。

2. 若危险作业罪与原案无关，可能中止二审、另案处理
   若危险作业罪是二审期间新发现的独立犯罪事实（例如原案为盗窃罪，二审发现行为人此前还有危险作业行为），二审法院可能根据《刑事诉讼法》第206条，裁定中止原案审理，将危险作业罪线索移送公安机关立案侦查。待危险作业罪案件审结后，再恢复原案二审程序，并根据两案判决结果决定是否合并执行刑罚。

3. 若危险作业罪情节轻微，可能终止审理或调解
   若危险作业罪情节显著轻微（如未造成实际危害后果，且行为人主动消除危险），法院可能依据《刑事诉讼法》第16条，裁定终止审理或建议检察机关撤回起诉。此外，若危险作业罪涉及民事赔偿（如对受害人的补偿），二审法院可组织调解，调解不成的告知当事人另行起诉。

实务建议：

• 行为人应主动向二审法院提交危险作业罪的相关证据（如现场照片、安全监管记录等），争取从轻处理；
  
• 若危险作业罪与原案无关，建议同步委托律师处理新罪案件，避免程序拖延；
  
• 法院处理时需严格区分“一罪”与“数罪”，避免重复评价同一行为（如危险作业罪与重大责任事故罪的竞合处理）。
  

提示：具体处理需结合案件证据、行为危害性及司法政策综合判断，若有细节疑问可直接向我咨询。