结论：医师暂停执业6个月，通过行政复议是有可能变更成3个月的，但具体能否变更以及变更的程度，取决于行政复议机关对原行政处罚决定的审查结果和相关法律法规的适用。
分析说明：
行政复议的性质与目的：
- 行政复议是公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，依法向有复议权的行政机关提出申请，由受理申请的行政机关对原具体行政行为依法进行审查并作出决定的活动。
- 其目的在于纠正违法的或不当的具体行政行为，保护公民、法人或其他组织的合法权益。
医师暂停执业的行政处罚：
- 医师暂停执业是卫生行政部门对医师违反医疗卫生管理法规、规章或诊疗护理规范、常规等行为所作出的一种行政处罚。
- 处罚的期限通常根据违法行为的性质、情节以及后果的严重程度来确定。
行政复议中可能变更处罚的情形：
- 如果原行政处罚决定存在事实不清、证据不足、适用法律错误或程序违法等情形，行政复议机关有权撤销或变更原处罚决定。
- 在医师暂停执业的案例中，如果医师能够证明原处罚决定存在上述问题，或者提供新的证据表明其违法行为情节较轻，行政复议机关可能会考虑减轻处罚，包括缩短暂停执业的期限。
变更处罚的考量因素：
- 行政复议机关在决定是否变更处罚时，会综合考虑违法行为的性质、情节、后果以及医师的认错态度、整改措施等因素。
- 如果医师在行政复议期间能够积极配合调查，主动承认错误并采取措施进行整改，这可能会对其处罚的变更产生积极影响。
法律建议：
- 如果您认为医师暂停执业6个月的处罚过重，且存在上述可能变更处罚的情形，您可以依法向有复议权的行政机关提出行政复议申请。
- 在申请行政复议时，建议您提供充分的证据和理由来支持您的请求，包括证明原处罚决定存在问题的证据、表明您违法行为情节较轻的证据以及您认错态度和整改措施的证明等。
- 同时，您也可以咨询专业律师（如我，国得森律师，专注于婚姻家庭、交通事故、工伤赔偿、刑事辩护、合同纠纷、行政纠纷领域）的意见，以更好地了解行政复议的程序和要求，提高申请的成功率。
后续行动：
- 在提出行政复议申请后，您需要耐心等待行政复议机关的审查结果。
- 如果行政复议机关决定变更原处罚决定，您需要按照新的处罚决定执行；如果行政复议机关维持原处罚决定，您也可以考虑通过行政诉讼等途径来维护自己的合法权益。