农村建住宅违法时，自然资源局是否有责任需分情况讨论：
自然资源局作为土地管理的主管部门，其职责是依法对土地资源进行管理和监督。如果自然资源局已经依法履行了其职责，比如对农村建住宅的用地申请进行了审批，对违法占地行为进行了查处等，那么在该农村建住宅违法的情况下，自然资源局是没有责任的。因为其已经按照法律法规的要求，尽到了管理和监督的职责。
自然资源局未依法履行职责，存在过错则需担责
行政不作为的责任：如果自然资源局在明知或应知农村建住宅存在违法占地行为的情况下，未依法进行查处，或者未按照法定程序进行审批，导致违法占地行为得以持续或扩大，那么自然资源局可能构成行政不作为，需要承担相应的行政责任。这种情况下，相关责任人员可能会受到行政处分，如警告、记过、降级等。
渎职或滥用职权的责任：如果自然资源局的工作人员在审批或监管过程中存在渎职行为，如故意放纵违法占地行为，或者滥用职权，为违法占地行为提供便利等，那么这些工作人员可能需要承担刑事责任。根据《刑法》的相关规定，国家机关工作人员滥用职权或者玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
法律建议：
对于农村居民：在建设住宅前，务必依法申请并获得相关部门的批准，确保用地的合法性。这不仅是遵守法律法规的要求，也是保护自身权益、避免不必要法律风险的必要举措。如果发现自然资源局存在不作为或滥用职权的行为，可以向其上级部门或纪检监察机关进行举报。
对于自然资源局：应加强对农村建住宅用地的审批和监管力度，确保依法履行职责。同时，应加强对工作人员的培训和管理，提高其法律意识和业务水平，防止出现渎职或滥用职权的行为。
可能后果：
如果自然资源局依法履行职责，那么农村建住宅违法的责任将完全由违法者承担，包括行政处罚、民事责任乃至刑事责任。
如果自然资源局未依法履行职责，存在过错，那么除了违法者需要承担责任外，自然资源局及其相关责任人员也可能需要承担相应的行政责任或刑事责任。
总之，农村建住宅违法时，自然资源局是否有责任取决于其是否依法履行了职责。如果有问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律解答。