面对法院判决的公司股权继承中大股东不配合登记的情况，你可以采取以下措施来维护自身权益：
沟通协商与第三方调解
- 沟通协商：首先，尝试与不配合的大股东进行坦诚的沟通，了解其不配合的具体原因。可能是对继承事宜存在误解，或者对股权价值有分歧，甚至可能有其他特殊顾虑。通过友好协商，解释清楚继承手续的法律规定、流程及其对各方的影响，力求达成一致意见。
- 第三方调解：如果直接沟通效果不佳，可以考虑邀请家族长辈、专业调解机构或律师介入调解。中立方凭借其专业能力和中立立场，有助于找到各方都能接受的解决方案，从而避免法律纠纷。
查阅并遵循公司章程
- 查阅公司章程：仔细查阅被继承人所在公司的公司章程，了解是否有关于股权继承的特别规定。公司章程是公司内部的“法律”，对股东具有约束力。
- 依据公司章程行事：如果公司章程中有关于股权继承的具体规定，且大股东的行为违反了这些规定，你可以依据章程条款要求大股东履行相应义务，包括配合办理股权继承登记手续。
法律途径解决
- 提起诉讼：若沟通、调解均无法解决问题，你可以向有管辖权的人民法院提起继承权诉讼，请求法院确认各继承人的继承权份额，并要求不配合的大股东协助办理股权继承手续。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来支持你的主张，如法院的判决书、继承协议、公司章程等。
- 申请强制执行：一旦获得法院的支持判决，而大股东仍不履行义务，你可以向法院申请强制执行。法院有权采取一系列措施来强制大股东履行义务，包括要求公司协助办理股权变更登记等。
注意事项
- 诉讼时效：在处理此类问题时，要注意诉讼时效等相关法律规定。确保在法定的期限内提起诉讼或申请强制执行，以免丧失法律保护的机会。
- 保持冷静理性：处理问题时保持冷静和理性态度至关重要。避免情绪化行为影响问题解决，甚至导致更严重的法律后果。
行动建议：
- 在采取任何行动之前，建议你先收集并整理好所有与股权继承相关的证据和文件，如法院的判决书、继承协议、公司章程、股东名册等。
- 如果对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求我的专业帮助。作为专注于公司事务的律师，我可以为你提供详细的法律意见和建议，帮助你制定合适的诉讼策略和解决方案。
可能面临的法律后果：
- 如果大股东仍然拒绝配合办理股权继承登记手续，并且你通过法律途径获得了法院的支持判决，那么大股东可能会面临法律制裁，包括被强制执行、罚款甚至承担刑事责任（在极端情况下）。
- 同时，你也需要意识到，法律程序可能需要一定的时间和成本。因此，在决定采取法律行动之前，要充分考虑这些因素，并做好相应的准备。