农村公厕选址在自建房旁是否合法，需结合具体情况判断，主要取决于是否符合相关法律法规及规划要求。以下从几个关键角度展开分析：

1. 规划合规性
   根据《城乡规划法》及地方性规划条例，农村公共设施（包括公厕）的选址需符合乡镇总体规划或村庄规划。若公厕选址已纳入当地规划，且规划文件明确标注了具体位置（如距离居民区一定范围），则通常合法；若未纳入规划或选址违反规划要求（如紧邻住宅、影响通风采光等），则可能涉嫌违规。

2. 相邻权保护
   《民法典》第二百八十八条规定，不动产的相邻权利人应按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则处理相邻关系。若公厕选址导致自建房出现异味、噪音、卫生问题等实质性影响，且未采取合理措施（如安装除臭设备、设置绿化隔离带），可能构成对相邻权的侵害，居民可要求调整选址或补偿。

3. 卫生与环保标准
   根据《公共厕所卫生标准》（GB/T 17217-2012）及地方环保要求，公厕需与居民区保持一定卫生防护距离（通常为10-30米，具体以地方规定为准）。若选址距离过近，可能违反卫生规范，居民可向环保或卫生部门投诉。

4. 程序合法性
   公厕选址需履行法定程序，包括公示、听证等环节。若村民对选址有异议，村委会或政府部门应组织协商；若未履行程序直接建设，可能因程序违法被叫停或撤销。

建议行动：

• 核实当地规划文件，确认公厕选址是否符合规划要求；
  
• 观察公厕建设是否对生活造成实质影响，收集证据（如照片、视频）；
  
• 与村委会或乡镇政府沟通，要求出示选址依据及卫生、环保评估报告；
  
• 若协商无果，可向自然资源部门（规划）、生态环境部门或司法所申请调解，或通过行政诉讼主张权利。
  

如有进一步细节（如具体距离、当地规定等），可提供更多信息以便更精准分析。