劳务公司和个人签订的工程合作协议书，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议有效的基本条件

1. 主体适格：

   • 劳务公司需具备合法的经营资质，即已依法登记注册并取得从事相关劳务业务的许可。
   • 个人需具备完全民事行为能力，能够独立承担民事责任。若个人为限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则其签订的协议可能因主体不适格而无效或效力待定。

2. 意思表示真实：

   • 双方签订协议时，应基于自愿、平等、公平的原则，意思表示真实，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。

3. 内容合法：

   • 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，协议中不得约定非法用工、逃避税收等违法内容。

4. 形式合法：

   • 虽然工程合作协议书并非必须采用书面形式，但为了明确双方的权利义务，减少纠纷，建议采用书面形式签订。若法律、行政法规规定或双方约定采用书面形式的，则应当采用书面形式。

二、可能影响协议效力的特殊情况

1. 劳务派遣的合规性：

   • 若劳务公司以劳务派遣的形式与个人签订工程合作协议书，但实际并未按照劳务派遣的相关规定操作（如未向劳动行政部门申请行政许可、未与用工单位签订劳务派遣协议等），则可能面临行政处罚，甚至影响协议的效力。但需注意，这并不直接导致协议无效，而是可能因违法操作而引发其他法律后果。

2. 个人是否具备相应资质：

   • 若工程合作涉及特定资质要求（如建筑、医疗、法律等），而个人未取得相应资质，则可能因违反法律、行政法规的强制性规定而导致协议部分或全部无效。

3. 协议中的免责条款：

   • 协议中若存在免除一方主要责任、加重对方责任、排除对方主要权利的免责条款，可能因违反公平原则而被认定为无效。

三、法律建议

1. 签订前审查：

   • 在签订工程合作协议书前，双方应仔细审查对方的主体资格、资质证书等文件，确保对方具备签订协议的合法资格。

2. 明确协议内容：

   • 协议中应明确双方的权利义务、工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬、社会保险等关键条款，避免模糊不清或遗漏重要内容。

3. 咨询专业律师：

   • 若对协议内容或签订过程存在疑问，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。虽然此处我作为马彩律师已经给出了相关分析，但具体案件仍需具体分析，您可以随时向我咨询。

4. 保留证据：

   • 签订协议后，双方应妥善保管协议文本及相关证据材料，以备不时之需。

总结来说，劳务公司和个人签订的工程合作协议书在符合法定条件的情况下是有效的。但为了确保协议的合法性和有效性，双方在签订前应仔细审查对方资格、明确协议内容，并在必要时咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。