无证驾驶三年后拘留是否合法，需分情况讨论，一般情况下，若违法行为未被及时处理且未超过法定追诉时效，拘留是合法的；但若已超过追诉时效，则不再处罚。以下是对此问题的详细分析：
一、无证驾驶的法律后果
无证驾驶是违反《中华人民共和国道路交通安全法》的行为。根据该法第九十九条的规定，未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。
二、拘留的时效性
行政处罚的时效：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。
- 对于无证驾驶这一违法行为，如果其在二年内未被公安机关交通管理部门发现，那么原则上不再给予行政处罚，包括拘留。
特殊情况：
- 如果无证驾驶行为在发生后被公安机关交通管理部门及时发现，并进行了立案处理，但由于某些原因（如当事人逃逸、案件复杂等）导致处罚决定未能在二年内作出，那么只要处罚决定在合理期限内作出，且符合法律规定，仍然是有效的。
- 另外，如果无证驾驶行为造成了严重后果（如交通事故导致人员伤亡或重大财产损失），那么即使超过了二年的时效，也可能因为涉及公民生命健康安全而有危害后果，而延长至五年内进行处罚。
三、三年后拘留的合法性分析
若违法行为在二年内未被发现：
- 根据行政处罚法的规定，此时不再给予行政处罚，包括拘留。因此，三年后对无证驾驶者进行拘留是不合法的。
若违法行为在二年内被发现但未及时处理：
- 如果公安机关交通管理部门在二年内发现了无证驾驶行为，并进行了立案处理，但由于某些原因未能在二年内作出处罚决定，且该行为未造成严重后果（即不涉及公民生命健康安全且有危害后果的情况），那么在超过二年后作出拘留决定可能面临合法性挑战。然而，如果处罚决定在合理期限内作出，且符合法律规定（如考虑了案件的复杂性、当事人的逃逸情况等），则可能仍然被视为合法。
- 如果无证驾驶行为造成了严重后果，且符合延长至五年内进行处罚的条件，那么三年后对无证驾驶者进行拘留是合法的。
四、建议
- 对于无证驾驶者：应严格遵守交通法规，不要无证驾驶。如果已经被发现无证驾驶，应积极配合公安机关交通管理部门的处理，避免逃逸或抗拒处罚，以免加重处罚后果。
- 对于公安机关交通管理部门：在发现无证驾驶行为后，应及时进行处理，避免超过法定时效。如果因特殊情况无法及时处理，应确保处罚决定在合理期限内作出，并符合法律规定。
如有任何关于交通运输领域的法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。