综合计算工时工作制下，加班费的规定主要依据工时超出标准工时的部分来计算，具体分为工作日、休息日和法定节假日三种情况。以下是对这一问题的详细解答：

一、综合计算工时工作制的基本概念

综合计算工时工作制是一种特殊的工时制度，它针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业职工，采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。在这种制度下，职工的平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。

二、加班费的具体规定

1. 工作日加班：

   • 在综合计算周期内，如果职工的实际工作时间超过法定标准工作时间（如每日8小时，每周40小时），超出部分应视为延长工作时间，即加班。
   • 加班费按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付。

2. 休息日加班：

   • 在综合计算周期内，如果职工在休息日工作，且该休息日不能安排补休的，应视为加班。
   • 但需要注意的是，由于综合计算工时工作制已经考虑了工作时间的灵活性，因此在综合计算周期内，如果总实际工作时间未超过法定标准工作时间，即使某一天或某几天工作了超过8小时，也不视为休息日加班。
   • 如果总实际工作时间超过了法定标准工作时间，且超出部分发生在休息日，则加班费按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付。不过，在实际操作中，更常见的是将这部分超出时间视为延长工作时间，并按150%的标准支付加班费，具体需根据地方规定和劳动合同约定来确定。

3. 法定节假日加班：

   • 无论综合计算周期内总实际工作时间是否超过法定标准工作时间，只要职工在法定节假日工作，就应视为加班。
   • 加班费按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付。

三、加班费的计算公式

1. 工作日加班费：

   • 公式：加班费 = 小时工资标准 × 150% × 加班小时数
   • 示例：假设某职工的小时工资标准为20元，某日加班3小时，则加班费为20 × 150% × 3 = 90元。

2. 休息日加班费（若按200%计算，且视为超出法定标准工作时间部分）：

   • 公式：加班费 = 日工资标准 × 200% × 加班天数（或按小时计算：小时工资标准 × 200% × 加班小时数）
   • 但更常见的是按延长工作时间计算，即150%的标准，具体需根据地方规定和劳动合同约定。

3. 法定节假日加班费：

   • 公式：加班费 = 日工资标准 × 300% × 加班天数（或按小时计算：小时工资标准 × 300% × 加班小时数）
   • 示例：假设某职工的日工资标准为160元，国庆节加班1天，则加班费为160 × 300% × 1 = 480元。

四、注意事项

1. 劳动合同约定：加班费的具体标准可能因劳动合同的约定而有所不同，因此应首先查看劳动合同中的相关规定。
2. 地方规定：不同地区可能对综合计算工时工作制下的加班费有具体规定，因此应了解并遵守当地的相关规定。
3. 证据保留：职工应保留好加班的证据，如加班通知、考勤记录等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。

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