公司捐款1000元的收据，在符合税法规定的情况下，是可以用来抵税的，且这种做法是合法的。以下从几个方面进行详细分析：

一、抵税的法律依据

根据《中华人民共和国企业所得税法》第九条，企业发生的公益性捐赠支出，在年度利润总额12%以内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除；超过年度利润总额12%的部分，准予结转以后三年内在计算应纳税所得额时扣除。这意味着，如果公司的捐款符合公益性捐赠的条件，并且捐款金额在年度利润总额的12%以内，那么公司可以凭借捐款收据在计算企业所得税时进行扣除，从而降低税负。

二、公益性捐赠的认定

1. 捐赠对象：公益性捐赠通常指向教育、扶贫、济困等公益慈善事业。公司需要确保捐款对象符合这一要求，例如捐款给红十字会、慈善总会等具有公益性捐赠税前扣除资格的慈善组织。
2. 捐赠方式：捐款应当通过公益性社会组织或者县级以上人民政府及其部门等国家机关进行，直接向受赠人捐赠通常不能享受税前扣除的优惠。
3. 捐赠收据：公司需要取得由财政部门统一印制的公益性捐赠票据，或者非税收入一般缴款书，并加盖接受捐赠单位的印章，作为税前扣除的凭证。

三、合法性的保障

1. 遵守税法规定：公司在享受捐款抵税优惠时，必须严格遵守税法的相关规定，确保捐款金额、捐赠对象、捐赠方式等均符合税法要求。
2. 保留相关证据：公司需要妥善保管捐款收据、捐赠协议等相关证据，以备税务机关查验。如果税务机关对公司捐款的合法性产生疑问，公司需要能够提供充分的证据来证明捐款的合规性。

四、实际操作建议

1. 了解税法政策：公司在进行捐款前，应当充分了解税法关于公益性捐赠的相关规定，确保捐款能够符合税前扣除的条件。
2. 选择合规的捐赠对象：公司应当选择具有公益性捐赠税前扣除资格的慈善组织进行捐款，以确保捐款的合法性和有效性。
3. 及时取得捐赠收据：公司在捐款后，应当及时向接受捐赠的单位索取捐赠收据，并妥善保管以备查验。

总结来说，公司捐款1000元的收据，在符合税法规定的情况下，是可以用来抵税的，且这种做法是合法的。但公司需要确保捐款符合公益性捐赠的条件，并严格遵守税法的相关规定，以确保捐款的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。