结论：同为13岁的未成年人发生性关系，男方在法律上一般不构成强奸罪，但可能涉及其他法律责任或保护措施，具体情况需结合实际分析。
法律背景与解释
刑事责任年龄：
- 根据我国《刑法》的规定，刑事责任年龄是划分行为人是否承担刑事责任的重要标准。对于已满12周岁不满14周岁的人，犯故意杀人、故意伤害罪，致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾，情节恶劣，经最高人民检察院核准追诉的，应当负刑事责任。但对于性犯罪，如强奸罪，该年龄段的人并不承担刑事责任。
强奸罪的构成：
- 强奸罪是指违背妇女意志，使用暴力、胁迫或者其他手段，强行与妇女发生性交的行为。在构成强奸罪时，要求行为人具有刑事责任能力，且明知自己的行为是违背妇女意志的。由于13岁的未成年人尚不具备完全的刑事责任能力，且对性行为的理解和判断能力有限，因此一般不构成强奸罪。
未成年人的特殊保护：
- 我国法律对未成年人有特殊的保护措施。对于同为13岁的未成年人发生性关系的情况，虽然男方不构成强奸罪，但双方的行为都可能受到法律的关注和干预。例如，相关部门可能会介入调查，了解双方的家庭背景、成长环境等，以确定是否需要采取保护措施或提供心理辅导等。
可能涉及的法律责任或保护措施
家庭保护：
- 双方家长或监护人应承担起监护责任，对未成年人进行正确的性教育和引导，防止类似事件再次发生。同时，家长或监护人也有权向相关部门寻求帮助和支持，以保护未成年人的合法权益。
学校保护：
- 学校作为未成年人成长的重要场所，也应承担起相应的保护责任。学校可以加强性教育课程的开设，提高未成年人的性意识和自我保护能力。同时，学校也可以与家长或监护人保持密切联系，共同关注未成年人的成长状况。
社会保护：
- 社会各界也应关注未成年人的性保护问题。相关部门可以加强宣传教育力度，提高公众对未成年人性保护的意识。同时，对于发现的未成年人性侵害案件，相关部门应及时介入调查和处理，以维护未成年人的合法权益。
特殊情况与建议
如果存在强迫、欺骗等情节：
- 尽管双方都是未成年人，但如果其中一方在发生性关系时存在强迫、欺骗等情节，那么该行为可能构成其他违法或犯罪行为（如猥亵儿童罪等，具体需根据实际情况判断）。此时，应立即向公安机关报案，由相关部门进行调查和处理。
建议寻求专业帮助：
- 对于此类复杂且敏感的问题，建议家长或监护人及时寻求专业律师或心理咨询师的帮助。他们可以提供更具体、更专业的法律建议和心理辅导，以帮助未成年人更好地应对和解决问题。
最后，如果你或你身边的人遇到了类似的问题，或者有任何法律上的疑问和困惑，都可以直接向我咨询。我会尽我所能为你提供专业、全面的法律帮助。