结论是：房子签半年合同扣两个月房租是否合法，不能一概而论，需根据合同具体条款及双方约定来判断。以下从不同角度进行分析：

一、合同自由原则与押金条款

1. 合同自由原则：在民事法律关系中，合同双方享有较大的自由度来约定合同条款，包括押金的数额和退还条件。只要合同条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的。

2. 押金条款的合法性：如果合同中明确约定了扣两个月房租作为押金，并且这一约定是双方真实意思的表示，没有欺诈、胁迫等情形，那么该条款在法律上是有效的。但需要注意的是，押金数额应当合理，不能过高，否则可能被视为不合理地加重了承租人的负担。

二、押金数额的合理性判断

1. 通常做法：在房屋租赁市场中，押金通常用于担保承租人履行合同义务，如按时支付租金、保持房屋完好等。押金的数额一般相当于一个月或两个月的租金，但具体数额应由双方协商确定。

2. 过高押金的法律后果：如果押金数额过高，超出了合理范围，可能被视为不合理地加重了承租人的负担，此时承租人可以要求降低押金数额或拒绝签订合同。如果已经签订了合同，承租人也可以以押金数额过高为由，向法院或仲裁机构申请调整。

三、合同解除与押金退还

1. 合同正常解除：如果合同在租赁期满后正常解除，且承租人没有违反合同约定，那么出租人应当退还押金。如果合同中约定了扣两个月房租作为押金，且这一约定是合法的，那么出租人在退还押金时，可以扣除相应的费用（如房屋损坏修复费用等），但应提供充分的证据证明扣除费用的合理性。

2. 合同提前解除：如果合同提前解除，且解除原因在于承租人（如承租人提前退租），那么出租人可能有权根据合同约定扣除部分或全部押金。但同样，出租人需要提供充分的证据证明扣除费用的合理性，且扣除的数额不应超过承租人实际造成的损失。

四、法律建议

1. 审查合同条款：在签订房屋租赁合同时，承租人应仔细审查合同条款，特别是关于押金的约定。如果认为押金数额过高或不合理，可以与出租人协商调整。

2. 保留证据：在租赁期间，承租人应妥善保管房屋及相关设施，避免造成损坏。同时，应保留好支付租金、押金等费用的凭证，以备不时之需。

3. 寻求法律帮助：如果因押金问题与出租人发生纠纷，承租人可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

举例说明：假设承租人与出租人签订了一份为期半年的房屋租赁合同，合同中约定扣两个月房租作为押金。在租赁期间，承租人按时支付租金，且没有造成房屋损坏。租赁期满后，出租人应当退还押金。如果出租人拒绝退还或扣除不合理费用，承租人可以要求出租人提供扣除费用的合理依据，并可以通过法律途径解决纠纷。

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