结论是，诈骗5000多元是否会留下案底，取决于是否构成犯罪以及是否受到刑事处罚。以下从不同角度为你详细分析：
一、是否构成犯罪
根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条的规定，诈骗公私财物，数额较大的，构成诈骗罪。这里的“数额较大”，根据相关司法解释，一般是指诈骗公私财物价值三千元至一万元以上。因此，诈骗5000多元，在数额上已经达到了诈骗罪的立案标准，原则上构成诈骗罪。
然而，是否构成犯罪并不仅仅取决于数额，还需要考虑其他因素，如行为人的主观故意、诈骗手段、是否具有非法占有目的等。如果行为人虽然诈骗了5000多元，但存在某些法定或酌定的从轻、减轻情节，或者证据不足，也可能不构成犯罪。
二、是否受到刑事处罚
如果构成犯罪并受到刑事处罚：
- 一旦被法院判定构成诈骗罪，并判处刑罚（如有期徒刑、拘役、罚金等），那么就会留下案底，即刑事犯罪记录。
- 这个案底会伴随行为人一生，对其未来的就业、升学、出国等可能产生不利影响。
如果不构成犯罪或未受到刑事处罚：
- 如果行为人虽然诈骗了5000多元，但因某种原因（如证据不足、情节显著轻微等）不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但因法定或酌定情节未受到刑事处罚（如免予刑事处罚、判处缓刑等），那么就不会留下案底。
- 但需要注意的是，即使未受到刑事处罚，行为人也可能因违反治安管理处罚法而受到行政处罚（如罚款、拘留等），这些行政处罚记录虽然不属于刑事犯罪记录，但也可能对行为人产生一定影响。
三、特殊情况下的处理
- 未成年人犯罪：如果行为人是未成年人，且犯罪情节较轻，根据相关法律规定，可能会对其犯罪记录进行封存，不向社会公开。但这并不意味着没有案底，只是在特定条件下不公开而已。
- 认罪认罚从宽制度：如果行为人自愿认罪认罚，并积极退赔赃款赃物，取得被害人谅解等，根据认罪认罚从宽制度，可能会对其从轻、减轻处罚，甚至免予刑事处罚。这种情况下，是否留下案底取决于最终的判决结果。
建议：如果你或你身边的人涉及此类情况，建议尽快咨询专业律师（即我本人），以便更准确地了解案件情况，制定合适的辩护策略，并尽可能争取从轻、减轻处罚或免予刑事处罚的机会。