结论：在交通事故案件中，若事故认定书清楚且尸检报告没有异议，但检察院二次退查，这通常意味着检察院在审查案件时认为证据或事实方面存在需要进一步查证或补充的情况。以下是对此问题的详细分析：
一、检察院二次退查的法律依据
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院在审查起诉阶段，如果认为案件事实不清、证据不足或者存在其他需要补充侦查的情形，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。在交通事故案件中，尽管事故认定书和尸检报告可能已经相对明确，但检察院仍可能基于以下原因决定二次退查：
- 证据完整性：检察院可能认为现有证据虽然基本清晰，但仍存在某些细节或环节需要进一步查证，以确保案件事实的完整性和准确性。
- 证据合法性：检察院可能对某些证据的收集程序或合法性存在疑问，需要公安机关补充说明或重新收集证据。
- 案件复杂性：交通事故案件可能涉及多方责任、保险理赔等复杂问题，检察院可能需要更多时间来审查和评估案件的整体情况。
二、二次退查的可能原因
- 事故细节需要进一步查证：例如，事故现场的具体情况、车辆行驶轨迹、驾驶员的操作行为等，可能需要通过更详细的调查或技术鉴定来确认。
- 证据链需要完善：虽然事故认定书和尸检报告是重要证据，但检察院可能认为还需要其他证据来形成完整的证据链，如目击者证言、监控录像等。
- 法律适用问题：检察院可能对案件的法律适用存在疑问，需要进一步研究相关法律法规或司法解释，以确保起诉的准确性和合法性。
三、应对建议
- 配合调查：如果案件被二次退查，当事人应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和信息。
- 关注进展：当事人可以关注案件的进展情况，及时了解检察院和公安机关的调查结果和意见。
- 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我可以根据案件的具体情况，为当事人提供专业的法律意见和辩护策略。
四、法律后果
- 如果案件最终被起诉：当事人将面临刑事审判，可能承担相应的刑事责任。此时，专业的刑事辩护将至关重要。
- 如果案件被不起诉或撤销：则当事人将免于刑事处罚。但无论如何，当事人都应积极应对调查，维护自己的合法权益。
总结来说，检察院二次退查并不意味着案件一定存在问题或当事人一定有罪。它只是检察院在审查起诉阶段的一种正常程序，旨在确保案件事实的清晰和证据的充分。当事人应保持冷静，积极配合调查，并在必要时寻求专业律师的帮助。