针对“超高违建是哪个部门负责”的问题，结论如下：

1. 主要监管部门：城市管理和综合执法部门（城管部门）

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条及第六十八条，未取得建设工程规划许可证或未按照规划许可内容进行建设的行为，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门（实践中多为城管部门）责令停止建设、限期改正或拆除。
   • 职责范围：城管部门负责查处违法建设行为，包括超高违建。其有权对在建或已建成的违建进行调查、认定，并依法作出行政处罚（如罚款、限期拆除等）。若当事人拒不履行，城管部门可申请法院强制执行。

2. 协同部门：自然资源与规划部门

   • 规划认定：自然资源与规划部门负责城乡规划的编制与审批，对建筑物是否符合规划要求具有最终认定权。若城管部门在查处过程中需确认违建性质（如是否超高、是否影响采光等），会要求该部门出具规划认定意见。
   • 联合执法：在重大违建案件中，自然资源与规划部门可能参与联合执法，提供技术支撑（如测绘、规划图纸比对等）。

3. 特殊情形下的其他部门

   • 消防部门：若违建存在消防安全隐患（如堵塞消防通道、影响消防设施使用），消防部门可依据《中华人民共和国消防法》责令整改或处罚。
   • 住建部门：若违建涉及房屋结构安全（如擅自加层导致承重结构改变），住建部门可依据《建设工程质量管理条例》介入调查。
   • 街道办事处/乡镇政府：根据《城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内，乡镇政府对未取得乡村建设规划许可证的违建有权查处。

法律建议与后续行动：

• 若您发现超高违建：可向当地城管部门举报（拨打12345市民热线或城管投诉电话），并提供具体地址、违建照片等证据。城管部门应在法定期限内（通常为7个工作日内）立案调查。
• 若您是违建当事人：需立即停止建设行为，并咨询律师评估违建性质及法律风险。若城管部门已下达《责令限期拆除决定书》，您可在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼，争取撤销处罚或延期拆除。
• 若涉及多方利益（如邻居因违建采光受阻）：可联合其他业主向城管部门投诉，并同步向法院提起相邻权纠纷诉讼，要求违建方排除妨碍、赔偿损失。

法律后果提示：

• 违建可能面临强制拆除、罚款（工程造价5%-10%）、没收违法所得等处罚。
• 若违建被拆除，当事人需自行承担拆除费用（包括人工、机械、垃圾清运等），且无法获得补偿。
• 违建记录可能影响个人征信，部分城市将违建行为纳入社会信用体系“黑名单”。

如有进一步疑问或需具体案件分析，可直接向我咨询。