房屋违建问题主要由多个政府部门协同管理，具体负责部门依据违法建设的性质、地点及严重程度而有所不同。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 城市管理综合行政执法部门（城管部门）：

   • 主要职责：负责城市规划区内违反规划建设管理规定的违法建筑的查处工作。对于市区内未经规划许可擅自搭建的建筑物、构筑物，城管部门有权责令停止建设、限期拆除等。
   • 应用场景：例如，市区内某居民未经许可，在自家楼顶搭建了阳光房，这属于城管部门的管辖范围。

2. 城乡规划主管部门（城乡规划局）：

   • 主要职责：负责城乡规划的实施监督管理，对未取得建设工程规划许可证或未按许可证规定进行建设的违法建筑进行查处。可依法作出处罚决定，包括责令改正、罚款、限期拆除等。
   • 应用场景：若某开发商在未取得建设工程规划许可证的情况下，擅自开工建设，这应由城乡规划主管部门进行查处。

3. 乡镇人民政府：

   • 主要职责：对乡、村庄规划区内的违法建设行为有管辖权。可以责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。乡镇政府对于本辖区农村集体土地上的违建负有直接管理责任。
   • 应用场景：在农村地区，若村民未经批准，在自家宅基地上擅自扩建房屋，这应由乡镇人民政府进行管理。

4. 土地行政主管部门（国土资源管理局）：

   • 主要职责：代表国家行使土地管理权，对违法占地建设行为进行查处。审查建房用地的合法性，查处未依法取得用地手续的建房行为。
   • 应用场景：若某企业未经批准，擅自占用耕地建设厂房，这应由土地行政主管部门进行查处。

5. 建设行政主管部门（住房和城乡建设局）：

   • 主要职责：对未依法办理施工许可手续进行建设的违法行为有管辖权。可以依法作出责令改正、停止施工及罚款等处罚决定。
   • 应用场景：若某建筑项目在未取得施工许可证的情况下擅自开工，这应由建设行政主管部门进行查处。

补充说明与建议：

• 不同地区可能会根据实际情况对违建管理职责进行调整和明确，可能设立专门的违法建设整治办公室等机构来协调各部门工作。因此，在具体操作时，建议先了解当地的具体管理规定和执法部门职责划分。
• 面对违建问题时，除了向相关部门咨询和反映外，还应积极配合政府部门的执法工作，避免问题进一步恶化。
• 若您对违建问题的处理存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。

总结：房屋违建问题的处理涉及多个政府部门，各部门根据各自职责范围进行协同管理。了解并遵守相关法律法规，积极配合政府部门的执法工作，是避免和解决违建问题的关键。