长期安排员工上夜班是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
法律法规层面：
- 根据《劳动法》的相关规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息一日，且每日工作时间一般不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时。若因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
- 对于夜班工作，法律并未明确禁止，但要求用人单位应合理安排工作时间和休息时间，确保劳动者的身体健康。若长期安排员工上夜班，且未给予足够的休息时间或未支付相应的夜班津贴，可能违反劳动法的相关规定。
劳动合同与规章制度层面：
- 劳动合同是用人单位与劳动者之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。若劳动合同中明确约定了工作时间、休息休假等条款，且长期安排上夜班符合合同约定，同时用人单位也按照合同约定支付了劳动报酬和夜班津贴，那么这种安排可能是合法的。
- 若用人单位的规章制度中规定了夜班工作的相关安排，且该规章制度经过民主程序制定并公示，且内容不违反法律法规的强制性规定，那么长期安排上夜班也可能是合法的。但同样需要确保劳动者的身体健康和休息时间。
劳动者权益保护层面：
- 长期安排上夜班可能对劳动者的身体健康产生不良影响，如生物钟紊乱、睡眠不足等。因此，用人单位在安排夜班工作时，应充分考虑劳动者的身体状况和承受能力，合理安排工作时间和休息时间。
- 若劳动者因长期上夜班导致身体健康受损，用人单位可能需要承担相应的法律责任。例如，支付医疗费、赔偿金等。
建议：
- 用人单位在安排夜班工作时，应遵守相关法律法规和劳动合同、规章制度的规定，确保劳动者的身体健康和休息时间。
- 劳动者在面对长期上夜班的情况时，应了解自己的权益和义务，与用人单位进行沟通协商，确保自己的合法权益得到保障。
- 若双方无法达成一致意见，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
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