关于质量保证协议需要盖什么章的问题，这主要取决于协议的具体内容和应用场景。不过，我可以根据一般情况和常见实践，给您一个较为全面的解答。
首先，质量保证协议是确保产品或服务质量符合特定标准或要求的重要文件。在签署这类协议时，通常需要加盖具有法律效力的印章，以证明协议的真实性和双方的承诺。
公司公章：
- 在大多数情况下，质量保证协议需要加盖公司的公章。公章是公司法律身份的象征，具有最高的法律效力。加盖公章意味着公司正式认可并承诺遵守协议中的各项条款。
合同专用章（如适用）：
- 如果公司有专门的合同专用章，并且该章被授权用于签署质量保证协议，那么也可以使用合同专用章。合同专用章通常用于特定类型的合同或协议，以表明公司对特定交易的重视和承诺。
其他相关印章（特定场景）：
- 在某些特定场景下，如涉及特定产品或项目的质量保证，可能需要加盖与该项目或产品相关的印章，如项目章、产品章等。但这通常是在公司内部有明确规定或授权的情况下进行的。
注意事项：
- 印章的真实性：确保所使用的印章是真实有效的，避免使用伪造或过期的印章。
- 印章的授权：确保签署协议的人员有权使用该印章，并且该印章的使用已经得到公司内部的适当授权。
- 协议的完整性：在加盖印章之前，确保协议的内容已经完整、准确地填写，并且双方已经就协议条款达成一致。
针对您提供的参考信息：
- 在房屋建筑和市政基础设施工程的质量保修书中，通常需要加盖施工单位的公章，以证明施工单位对保修义务的承诺。
- 在食用农产品的承诺达标合格证中，虽然不直接涉及质量保证协议，但生产者或销售者需要在合格证上签字或盖章，以证明其对产品质量安全的承诺。这同样体现了印章在质量保证方面的重要性。
综上所述，质量保证协议通常需要加盖公司的公章或合同专用章（如适用），以确保协议的法律效力和双方的承诺。在签署协议前，请务必确认印章的真实性、授权情况以及协议的完整性。