公安将案件移交检察院后，是否会留有案底，这主要取决于案件的最终处理结果。以下是从不同角度进行的详细分析：
案件被检察院作出不起诉决定：
- 如果案件在移交检察院后，经过审查，检察院认为犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者情节显著轻微不构成犯罪，或者存在其他依法不追究刑事责任的情形，检察院会作出不起诉的决定。
- 在这种情况下，由于犯罪嫌疑人并未被法院判决有罪，因此不会留下案底。
案件被检察院提起公诉并经法院审判：
- 如果检察院认为犯罪嫌疑人的行为构成犯罪，且证据充分，会向法院提起公诉。
- 案件经法院审判后，如果犯罪嫌疑人被判决有罪，无论是否实际服刑（如被判处缓刑、管制等），都会留下案底。因为案底是指犯罪记录，即犯罪行为被法院判决认定后所形成的记录。
- 特别地，如果犯罪嫌疑人被判处缓刑，虽然缓刑犯在缓刑考验期内不需要实际服刑，但其犯罪行为已经被司法机关认定并作出了有罪判决，因此同样会留下案底。
案件在审查起诉阶段被退回补充侦查：
- 虽然案件在移交检察院后，有可能因证据不足被退回公安机关补充侦查，但这并不直接影响案底的形成。
- 关键在于补充侦查后，检察院是否会再次提起公诉，以及法院是否会判决有罪。如果最终判决有罪，则会留下案底；如果检察院再次作出不起诉决定，则不会留下案底。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百条的规定，依法受过刑事处罚的人，在入伍、就业的时候，应当如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，不得隐瞒。这进一步强调了案底对个人未来可能产生的影响。
- 作为一名专业律师，我建议当事人在面临刑事案件时，应积极配合司法机关的调查和审判工作，同时寻求专业法律帮助，以维护自己的合法权益。如果对案件处理结果有疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据案件具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，公安将案件移交检察院后是否会留有案底，取决于案件的最终处理结果。如果案件被检察院作出不起诉决定，则不会留下案底；如果案件被提起公诉并经法院审判有罪，则会留下案底。