二次车辆抵押合同只有一份并不直接决定其合法性，合同合法性取决于合同内容是否符合法律规定以及双方当事人的真实意愿。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同份数与合法性的关系：

   • 合同的合法性并不直接取决于其份数。一份合同，无论是一式一份还是一式多份，只要其内容合法、双方当事人意思表示真实且不违反法律、行政法规的强制性规定，该合同就是合法的。
   • 在实际操作中，为了保障双方当事人的权益，合同通常会一式多份，由双方当事人各执一份或数份。但这并不是合同合法性的必要条件。

2. 二次车辆抵押合同的合法性要件：

   • 合同内容合法：二次车辆抵押合同必须明确约定抵押物、抵押担保的范围、抵押期限、双方的权利义务等关键条款，且这些条款必须符合法律、行政法规的规定。
   • 双方当事人意思表示真实：合同双方当事人在签订合同时必须出于真实意愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
   • 不违反法律、行政法规的强制性规定：合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得违反物权法、担保法等相关法律法规的规定。

3. 二次车辆抵押的特别注意事项：

   • 抵押权登记：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以车辆等动产抵押的，抵押权自抵押合同生效时设立；未经登记，不得对抗善意第三人。因此，在签订二次车辆抵押合同后，应及时办理抵押权登记手续，以保障抵押权的效力。
   • 抵押物价值评估：在签订二次车辆抵押合同时，应对抵押物的价值进行评估，确保抵押物的价值足以覆盖债务金额，以降低抵押权实现的风险。
   • 优先受偿权问题：如果同一车辆上存在多个抵押权，根据法律规定，抵押权已登记的，按照登记的时间先后确定清偿顺序；抵押权已登记的先于未登记的受偿；抵押权未登记的，按照债权比例清偿。因此，在签订二次车辆抵押合同时，应关注其他抵押权的情况，以避免自身权益受损。

4. 建议：

   • 在签订二次车辆抵押合同时，建议双方当事人咨询专业律师或法律机构，以确保合同内容的合法性和有效性。
   • 合同签订后，应及时办理抵押权登记手续，并妥善保管合同文本和相关凭证。
   • 在合同履行过程中，如发生争议或纠纷，应及时通过法律途径解决，以维护自身合法权益。

综上所述，二次车辆抵押合同只有一份并不直接决定其合法性，关键在于合同内容是否符合法律规定以及双方当事人的真实意愿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。