高标准农田建设与森林重叠可能违反《中华人民共和国森林法》以及《基本农田保护条例》等相关法律法规，具体需根据重叠情形判断。以下从不同角度进行分析：

1. 若重叠部分属于林地：

   • 根据《中华人民共和国森林法》第三十七条规定，矿藏勘查、开采以及其他各类工程建设，应当不占或者少占林地；必须占用或者征收、征用林地的，应当经县级以上人民政府林业主管部门审核同意，并依照有关土地管理的法律、行政法规办理建设用地审批手续。
   • 若高标准农田建设未经林业主管部门审核同意，擅自占用林地，则违反了该条规定，可能面临责令限期恢复植被和林业生产条件、罚款等行政处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

2. 若重叠部分属于基本农田且同时为林地：

   • 根据《基本农田保护条例》第十五条规定，基本农田保护区经依法划定后，任何单位和个人不得改变或者占用。国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目选址确实无法避开基本农田保护区，需要占用基本农田，涉及农用地转用或者征收土地的，必须经国务院批准。
   • 若高标准农田建设属于非国家重点建设项目，且未经国务院批准擅自占用基本农田（即使该基本农田同时为林地），则违反了该条规定，可能面临责令改正、限期拆除在非法占用的基本农田上新建的建筑物和其他设施、恢复原状、罚款等行政处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

3. 若重叠部分涉及生态保护红线：

   • 若高标准农田建设与森林重叠的部分位于生态保护红线内，则还需遵守生态保护红线的相关管理规定。根据《关于在国土空间规划中统筹划定落实三条控制线的指导意见》等文件，生态保护红线内，自然保护地核心保护区原则上禁止人为活动，其他区域严格禁止开发性、生产性建设活动。
   • 若高标准农田建设属于开发性、生产性建设活动，且未经相关主管部门批准擅自占用生态保护红线内的森林，则可能面临更为严格的法律责任，包括但不限于责令停止违法行为、限期恢复原状、罚款等。

建议：在进行高标准农田建设时，应充分进行项目选址的合法性审查，确保不占用林地、基本农田以及生态保护红线等敏感区域。如确实无法避免，应依法办理相关审批手续，确保项目建设的合法性和合规性。如有具体法律问题，可直接向我咨询。