在涉及两个孩子均非亲生的情况下，法院的判决会综合考虑多方面因素，主要包括解除婚姻关系、抚养权归属、抚养费及精神损害赔偿等，具体判决结果会根据实际情况有所不同。以下是详细分析：

1. 婚姻关系解除：若此类情况成为离婚诉讼的导火索，且原告能提供确凿证据（如亲子鉴定报告）证明孩子非亲生，法院通常会认定夫妻感情确已破裂，从而判决解除婚姻关系。

2. 抚养权归属：

   • 非亲生子女：对于非亲生子女，男方（若非生物学父亲）通常无需承担抚养义务，法院也不会将抚养权判归其所有。抚养权一般会判给生物学父母，若生物学父母无法履行抚养义务，则可能由其他合适亲属或社会福利机构抚养。
   • 若男方误以为孩子是亲生并抚养多年：即便孩子非亲生，若男方已与孩子形成事实上的抚养关系，且男方有抚养意愿和能力，法院在判决时可能会考虑这一因素，但最终抚养权归属仍需根据生物学父母的情况及孩子的最佳利益来决定。

3. 抚养费问题：

   • 男方无需支付非亲生子女的抚养费：在确认孩子非男方亲生后，男方无需再承担抚养费支付义务。若男方此前已支付抚养费，可依法向女方追偿。
   • 女方需承担抚养费：无论婚姻关系是否存续，女方作为生物学母亲，均需承担抚养非亲生子女的义务。若女方无力承担，法院可能会根据具体情况判决其他亲属或社会福利机构协助抚养。

4. 精神损害赔偿：

   • 男方有权请求精神损害赔偿：在确认孩子非男方亲生后，男方作为无过错方，有权向女方请求精神损害赔偿。赔偿金额会根据女方的过错程度、男方的精神损害程度及当地经济水平等因素综合确定。
   • 女方需承担赔偿责任：若女方存在故意隐瞒、欺骗等行为，导致男方遭受精神损害，女方需承担相应的赔偿责任。

5. 其他财产分割问题：在离婚诉讼中，法院还会根据《民法典》的相关规定，对夫妻共同财产进行分割。若女方存在过错（如隐瞒孩子非亲生的事实），法院在分割财产时可能会适当倾斜，以保护男方的合法权益。

举例说明：假设一对夫妻在婚姻关系存续期间生育了两个孩子，后经亲子鉴定确认孩子均非男方亲生。男方因此提起离婚诉讼，并要求女方返还已支付的抚养费、支付精神损害赔偿金，并分割夫妻共同财产。在此情况下，法院可能会判决解除婚姻关系、孩子抚养权归女方（或生物学父亲）、女方返还男方已支付的抚养费、支付男方精神损害赔偿金，并根据实际情况分割夫妻共同财产。

建议：若您面临类似情况，建议及时收集证据（如亲子鉴定报告、聊天记录等），并咨询专业律师以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。